Algoritmy a jejich implementace
V letním semestru 2016/2017 přednáším o tom, jak se algoritmy implementují na reálných počítačích. Bude to přednáška na pomezí teorie a praxe. Očekávat můžete rychlokurs pokročilých partií jazyka C, stručný přehled charakteristik hardwaru důležitých pro optimalizaci algoritmů, základy paralelního programování na SMP/NUMA a zajímavou teorii s překvapivými výsledky v praxi – například cache-oblivious algoritmy. Viz též letáček.
Přednáška se koná v pondělí od 14:00 v S9, cvičení v úterý od 9:00 v SU1 vede Ondra Hlavatý.
Co se přednášelo
datum | téma |
---|---|
27. 2. | Motivace: záhada transponování matice. Úvod do hlubin jazyka C11: Typový systém a reprezentace objektů (na co se lze spolehnout a na co už ne). Viz Medvědův průvodce po Céčku. |
28. 2. | Pokračování na prvním cvičení: Výrazy, literály a operátory. Vedlejší efekty a synchronizační body. Jak číst deklarace, kvalifikátory (const, volatile, restrict) a třídy uložení (static a spol.). |
6. 3. | Pokračování Céčka: Funkce, jejich deklarace. Příkazy. Funkce s variabilním počtem parametrů. Fáze překladu, úvod k preprocesoru. |
7. 3. | Pokračování na druhém cvičení: Preprocesor a pravidla nahrazování maker. Standardní knihovna, GCCčková rozšíření jazyka. |
13. 3. | Jak číst přeložené programy. Základy assembleru na IA32/AMD64: datové typy, registry, adresní módy, volací konvence. Různé překlady téhož programu. |
20. 3. | Cache a jejich hierarchie. Správa paměti, TLB a jejich interakce s cachemi. Paměti SDRAM a jejich rozhraní (aproximace). Co z toho plyne pro programátory? Graf rychlosti přístupů k paměti a věštění z něj. Spusťte si kreslítko grafů (viz repozitář) na svém stroji a zamyslete se nad jeho výstupem. |
27. 3. | Jak procesor zpracovává instrukce. Pipelining, superskalární a out-of-order vykonávání, spekulativní vyhodnocování a predikce skoků. Techniky predikce skoků (podmíněných i nepřímých). Různé implementace architektury x86. |
3. 4. | Počítače s více procesory: SMP, protokoly MESI a MOESI pro koherenci cache. Jak programovat na SMP. Procesy a vlákna a jejich synchronizace (atomické instrukce, thread-local storage, sdílení paměti, zámky, semafory). Příklad s frontou. |
10. 4. | Mnoho způsobů, jak si pořídit race condition, deadlock nebo livelock. Granularita zámků. Implementace zámků. Transakční paměť softwarová i hardwarová. Paměťový model C11. NUMA. Spusťte si na svém počítači machinfo (viz repozitář), co asi vypíše? |
17. 4. | Ēostre, Paasfees, Великден, Ülestõusmispühad, Πάσχα, Páskar, 復活祭, Pace. |
24. 4. | Skutečný SMP hardware: Vícejádrové procesory, HyperThreading a Bulldozer. Různé topologie víceprocesorových strojů, FSB, HyperTransport, QuickPath. Zvyšujeme počet procesorů: NumaConnect, AMD Magny-Cours a triky v jeho implementaci L3 cache. Directory-based koherence a HT-Assist. |
25. 4. | Náhradní přednáška od 10:40 v S221 (chodba 2. patro východ). Vektorové instrukce – nahlédnutí do zvěřince (MMX, SSE, AVX). Netemporální přístup k paměti a prefetche. Vektorové programování v Céčku. Zmínka o AVX-512. |
9. 5. | Náhradní přednáška od 10:40 v S221 (chodba 2. patro východ). Příklad ze života: Jak jsme programovali sorter pro LibUCW. Interní třídící algoritmy a jejich chování. Externí třídění aneb proč disk není páska. |
15. 5. | Cache-oblivious algoritmy: definice I/O modelu, cache-oblivious a cache-aware modelů. Násobení matic metodou Rozděl a panuj, "fraktální" reprezentace matic. Model kontra realita, odhad na kompetitivnost LRU. |
22. 5. | Cache-oblivious algoritmy: vyhledávání, van Emde-Boasova reprezentace binárních stromů, třídění v I/O modelu, odpovídající dolní odhad. |
Odkazy
- Repozitář s materiály k přednášce:
- Videozáznamy z přednášek z roku 2015
- Různé texty k přednášce:
- Céčko a Unix:
- Norma jazyka C11
- Single Unix Specification v4 (nástupce POSIXu)
- System V ABI (pro 32-bitový mód; na Linuxu berte s rezervou)
- AMD64 ABI (64-bitový mód)
- Dokumentace ke GCC
- comp.lang.c FAQ (pozor, mírně zastaralé)
- Funny C/C++ Declarations :)
- přednáška Jonase Skeppstedta o paralelním programování, v níž je mimo jiné pěkně převyprávěn paralelní paměťový model C11
- Hardware:
- What Every Programmer Should Know About Memory od Ulricha Dreppera
- Sandpile – prakticky vše o procesorech x86/amd64
- Dokumentace od procesorů AMD (za přečtení stojí zejména AMD64 Architecture Programmer's Manual a Software Optimization Guide)
- Totéž od Intelu
- Dokumentace od GPU AMD/ATI
- Optimalizační triky:
- Bit Hacks – různé triky s čísly a bitovými operacemi
- Software optimization resources Agnera Foga
- Teorie:
- Practical Data Structures – bakalářská práce Michala Pokorného, mimo jiné o cache-oblivious datových strukturách
- Cache-Oblivious Algorithms and Data Structures – úvodní text od Erika Demaine
- The I/O Complexity of Sorting and Related Problems (A. Aggarwal, J. S. Vitter)
- Cache-Oblivious B-Trees (M. A. Bender, E. D. Demaine, M. Farach-Colton)