]> mj.ucw.cz Git - eval.git/commitdiff
Created documentation
authorTomas Gavenciak <gavento@ucw.cz>
Fri, 10 Sep 2010 18:24:47 +0000 (20:24 +0200)
committerTomas Gavenciak <gavento@ucw.cz>
Fri, 10 Sep 2010 18:24:47 +0000 (20:24 +0200)
Unsing Sphinx, restructured text
Updated documentation strings in config.py and config_parser.py
Makefile for running nosetests and building docs

t/Makefile [new file with mode: 0644]
t/doc/Makefile [new file with mode: 0644]
t/doc/conf.py [new file with mode: 0644]
t/doc/config.rst [new file with mode: 0644]
t/doc/eval_timing.rst [new file with mode: 0644]
t/doc/index.rst [new file with mode: 0644]
t/doc/log.rst [new file with mode: 0644]
t/moe/config.py
t/moe/config_parser.py

diff --git a/t/Makefile b/t/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4b7eeb7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,7 @@
+.PHONY: doc test
+
+doc:
+       cd doc; make html
+
+test:
+       nosetests moe.config_test
diff --git a/t/doc/Makefile b/t/doc/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a372cc7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,89 @@
+# Makefile for Sphinx documentation
+#
+
+# You can set these variables from the command line.
+SPHINXOPTS    =
+SPHINXBUILD   = sphinx-build
+PAPER         =
+BUILDDIR      = _build
+
+# Internal variables.
+PAPEROPT_a4     = -D latex_paper_size=a4
+PAPEROPT_letter = -D latex_paper_size=letter
+ALLSPHINXOPTS   = -d $(BUILDDIR)/doctrees $(PAPEROPT_$(PAPER)) $(SPHINXOPTS) .
+
+.PHONY: help clean html dirhtml pickle json htmlhelp qthelp latex changes linkcheck doctest
+
+help:
+       @echo "Please use \`make <target>' where <target> is one of"
+       @echo "  html      to make standalone HTML files"
+       @echo "  dirhtml   to make HTML files named index.html in directories"
+       @echo "  pickle    to make pickle files"
+       @echo "  json      to make JSON files"
+       @echo "  htmlhelp  to make HTML files and a HTML help project"
+       @echo "  qthelp    to make HTML files and a qthelp project"
+       @echo "  latex     to make LaTeX files, you can set PAPER=a4 or PAPER=letter"
+       @echo "  changes   to make an overview of all changed/added/deprecated items"
+       @echo "  linkcheck to check all external links for integrity"
+       @echo "  doctest   to run all doctests embedded in the documentation (if enabled)"
+
+clean:
+       -rm -rf $(BUILDDIR)/*
+
+html:
+       $(SPHINXBUILD) -b html $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/html
+       @echo
+       @echo "Build finished. The HTML pages are in $(BUILDDIR)/html."
+
+dirhtml:
+       $(SPHINXBUILD) -b dirhtml $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/dirhtml
+       @echo
+       @echo "Build finished. The HTML pages are in $(BUILDDIR)/dirhtml."
+
+pickle:
+       $(SPHINXBUILD) -b pickle $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/pickle
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can process the pickle files."
+
+json:
+       $(SPHINXBUILD) -b json $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/json
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can process the JSON files."
+
+htmlhelp:
+       $(SPHINXBUILD) -b htmlhelp $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/htmlhelp
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can run HTML Help Workshop with the" \
+             ".hhp project file in $(BUILDDIR)/htmlhelp."
+
+qthelp:
+       $(SPHINXBUILD) -b qthelp $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/qthelp
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can run "qcollectiongenerator" with the" \
+             ".qhcp project file in $(BUILDDIR)/qthelp, like this:"
+       @echo "# qcollectiongenerator $(BUILDDIR)/qthelp/Moe.qhcp"
+       @echo "To view the help file:"
+       @echo "# assistant -collectionFile $(BUILDDIR)/qthelp/Moe.qhc"
+
+latex:
+       $(SPHINXBUILD) -b latex $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/latex
+       @echo
+       @echo "Build finished; the LaTeX files are in $(BUILDDIR)/latex."
+       @echo "Run \`make all-pdf' or \`make all-ps' in that directory to" \
+             "run these through (pdf)latex."
+
+changes:
+       $(SPHINXBUILD) -b changes $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/changes
+       @echo
+       @echo "The overview file is in $(BUILDDIR)/changes."
+
+linkcheck:
+       $(SPHINXBUILD) -b linkcheck $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/linkcheck
+       @echo
+       @echo "Link check complete; look for any errors in the above output " \
+             "or in $(BUILDDIR)/linkcheck/output.txt."
+
+doctest:
+       $(SPHINXBUILD) -b doctest $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/doctest
+       @echo "Testing of doctests in the sources finished, look at the " \
+             "results in $(BUILDDIR)/doctest/output.txt."
diff --git a/t/doc/conf.py b/t/doc/conf.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..30f2a77
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,198 @@
+# -*- coding: utf-8 -*-
+#
+# Moe documentation build configuration file, created by
+# sphinx-quickstart on Tue Aug 31 02:28:06 2010.
+#
+# This file is execfile()d with the current directory set to its containing dir.
+#
+# Note that not all possible configuration values are present in this
+# autogenerated file.
+#
+# All configuration values have a default; values that are commented out
+# serve to show the default.
+
+import sys, os
+
+sys.path.append('..')
+
+# If extensions (or modules to document with autodoc) are in another directory,
+# add these directories to sys.path here. If the directory is relative to the
+# documentation root, use os.path.abspath to make it absolute, like shown here.
+#sys.path.append(os.path.abspath('.'))
+
+# -- General configuration -----------------------------------------------------
+
+# Add any Sphinx extension module names here, as strings. They can be extensions
+# coming with Sphinx (named 'sphinx.ext.*') or your custom ones.
+extensions = ['sphinx.ext.autodoc', 'sphinx.ext.todo', 'sphinx.ext.coverage']
+
+todo_include_todos = True
+
+# Add any paths that contain templates here, relative to this directory.
+templates_path = ['_templates']
+
+# The suffix of source filenames.
+source_suffix = '.rst'
+
+# The encoding of source files.
+#source_encoding = 'utf-8'
+
+# The master toctree document.
+master_doc = 'index'
+
+# General information about the project.
+project = u'Moe'
+copyright = u'2010, MJ, gavento'
+
+# The version info for the project you're documenting, acts as replacement for
+# |version| and |release|, also used in various other places throughout the
+# built documents.
+#
+# The short X.Y version.
+version = '0'
+# The full version, including alpha/beta/rc tags.
+release = '0'
+
+# The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation
+# for a list of supported languages.
+#language = None
+
+# There are two options for replacing |today|: either, you set today to some
+# non-false value, then it is used:
+#today = ''
+# Else, today_fmt is used as the format for a strftime call.
+#today_fmt = '%B %d, %Y'
+
+# List of documents that shouldn't be included in the build.
+#unused_docs = []
+
+# List of directories, relative to source directory, that shouldn't be searched
+# for source files.
+exclude_trees = ['_build']
+
+# The reST default role (used for this markup: `text`) to use for all documents.
+#default_role = None
+
+# If true, '()' will be appended to :func: etc. cross-reference text.
+#add_function_parentheses = True
+
+# If true, the current module name will be prepended to all description
+# unit titles (such as .. function::).
+#add_module_names = True
+
+# If true, sectionauthor and moduleauthor directives will be shown in the
+# output. They are ignored by default.
+#show_authors = False
+
+# The name of the Pygments (syntax highlighting) style to use.
+pygments_style = 'sphinx'
+
+# A list of ignored prefixes for module index sorting.
+#modindex_common_prefix = []
+
+
+# -- Options for HTML output ---------------------------------------------------
+
+# The theme to use for HTML and HTML Help pages.  Major themes that come with
+# Sphinx are currently 'default' and 'sphinxdoc'.
+html_theme = 'sphinxdoc'
+
+# Theme options are theme-specific and customize the look and feel of a theme
+# further.  For a list of options available for each theme, see the
+# documentation.
+html_theme_options = {'nosidebar':'true'}
+
+# Add any paths that contain custom themes here, relative to this directory.
+#html_theme_path = []
+
+# The name for this set of Sphinx documents.  If None, it defaults to
+# "<project> v<release> documentation".
+#html_title = None
+
+# A shorter title for the navigation bar.  Default is the same as html_title.
+#html_short_title = None
+
+# The name of an image file (relative to this directory) to place at the top
+# of the sidebar.
+#html_logo = None
+
+# The name of an image file (within the static path) to use as favicon of the
+# docs.  This file should be a Windows icon file (.ico) being 16x16 or 32x32
+# pixels large.
+#html_favicon = None
+
+# Add any paths that contain custom static files (such as style sheets) here,
+# relative to this directory. They are copied after the builtin static files,
+# so a file named "default.css" will overwrite the builtin "default.css".
+html_static_path = ['_static']
+
+# If not '', a 'Last updated on:' timestamp is inserted at every page bottom,
+# using the given strftime format.
+#html_last_updated_fmt = '%b %d, %Y'
+
+# If true, SmartyPants will be used to convert quotes and dashes to
+# typographically correct entities.
+#html_use_smartypants = True
+
+# Custom sidebar templates, maps document names to template names.
+#html_sidebars = {}
+
+# Additional templates that should be rendered to pages, maps page names to
+# template names.
+#html_additional_pages = {}
+
+# If false, no module index is generated.
+#html_use_modindex = True
+
+# If false, no index is generated.
+#html_use_index = True
+
+# If true, the index is split into individual pages for each letter.
+#html_split_index = False
+
+# If true, links to the reST sources are added to the pages.
+#html_show_sourcelink = True
+
+# If true, an OpenSearch description file will be output, and all pages will
+# contain a <link> tag referring to it.  The value of this option must be the
+# base URL from which the finished HTML is served.
+#html_use_opensearch = ''
+
+# If nonempty, this is the file name suffix for HTML files (e.g. ".xhtml").
+#html_file_suffix = ''
+
+# Output file base name for HTML help builder.
+htmlhelp_basename = 'Moedoc'
+
+
+# -- Options for LaTeX output --------------------------------------------------
+
+# The paper size ('letter' or 'a4').
+#latex_paper_size = 'letter'
+
+# The font size ('10pt', '11pt' or '12pt').
+#latex_font_size = '10pt'
+
+# Grouping the document tree into LaTeX files. List of tuples
+# (source start file, target name, title, author, documentclass [howto/manual]).
+latex_documents = [
+  ('index', 'Moe.tex', u'Moe Documentation',
+   u'MJ, gavento', 'manual'),
+]
+
+# The name of an image file (relative to this directory) to place at the top of
+# the title page.
+#latex_logo = None
+
+# For "manual" documents, if this is true, then toplevel headings are parts,
+# not chapters.
+#latex_use_parts = False
+
+# Additional stuff for the LaTeX preamble.
+#latex_preamble = ''
+
+# Documents to append as an appendix to all manuals.
+#latex_appendices = []
+
+# If false, no module index is generated.
+#latex_use_modindex = True
diff --git a/t/doc/config.rst b/t/doc/config.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..57d58c1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,34 @@
+Moe configuration
+=================
+
+The configuration consists of lazy definition-style configuration resolver and configuration parser.
+
+.. contents::
+
+
+Config elements
+----------------
+
+.. automodule:: moe.config
+       :members: ConfigError, UndefinedError, VariableNameError, VariableFixedError, CyclicConfigError, ConfigTree, ConfigElem, ConfigCondition
+       :undoc-members:
+
+       
+Internal classes
+++++++++++++++++
+
+.. autoclass:: moe.config.Operation
+       :members:
+       :undoc-members:
+.. autoclass:: moe.config.ConfigVar
+       :members:
+       :undoc-members:
+.. autoclass:: moe.config.ConfigExpression
+       :members:
+       :undoc-members:
+
+
+Config parser
+--------------
+
+.. automodule:: moe.config_parser
diff --git a/t/doc/eval_timing.rst b/t/doc/eval_timing.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c35ae12
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,65 @@
+Evaluation timeline
+====================
+
+Main pipeline
+-------------
+
+======= ========================
+Time   Action
+======= ========================
+\      Apply command-line overrides, set basic builtins (`CONFIG_FILE`, `VERBOSITY`, ...)
+\      FIX: `CONFIG_FILE`
+\      Load `CONFIG_FILE`
+\      FIX: `LOG_FILE`, `VERBOSITY`, `HOME`, `TDIR`, `BOXDIR`, `HOOKS`, `TEST_HOOKS`, ...
+\      Start logging to `LOG_FILE`
+\      Insert predefined hooks, `HOOKS` and `TEST_HOOKS` to pipelines
+5      [m] Check basic settings, directories and rights
+10     [m] Task **must** be ready (rsynced, pulled). Locate and fix `PDIR`
+15     [m] Load `TASK_CONFIG_FILE` (dep. on `PDIR`)
+20     [m] Check `TASK_TYPE` and depending on that, initialize the module and insert future actions
+**For 'standard':**
+--------------------------------
+25     [tt] Locate the source
+30     [tt] Initialize sandbox module
+35     [tt] Initialize compiler module, insert its hooks 
+50     [cpl] Compile the source, perhaps using the sandbox
+60     [tt] Run test pipeline for each `TEST` of `TESTS`
+**For 'opendata':**
+--------------------------------
+25     [tt] Locate the data files (as a dir)
+30     [tt] Initialize sandbox module (if needed)
+40     [tt] Initialize judge module, insert its hooks 
+60     [tt] Run test pipeline for each `TEST` of `TESTS` 
+**Recovery**
+--------------------------------
+70     Any failure jumps to this time
+80     [*] Cleanup must be finished
+\      Write metafile
+======= ========================
+
+Test pipeline
+-------------
+
+======= ========================
+Time   Action
+======= ========================
+\      Tee logging to test log file
+**For 'standard':**
+--------------------------------
+10     [tt] Copy test data to `TDIR` and to `BOXDIR`
+30     [tt] Run testee (inside sandbox)
+40     [tt] Run judge (inside sandbox)
+50     [tt] Read/parse judge result
+60     [tt] Copy program output to `TDIR`
+**For 'opendata':**
+--------------------------------
+10     [tt] Copy test data to `TDIR` and to `BOXDIR`
+20     [tt] Locate the data file, copy to 
+40     [tt] Run judge (inside sandbox)
+50     [tt] Read/parse judge result
+**Recovery**
+--------------------------------
+70     Any failure jumps to this time
+80     [*] Cleanup must be finished
+\      Write metafile
+======= ========================
diff --git a/t/doc/index.rst b/t/doc/index.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d30fb17
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,22 @@
+=================
+Moe documentation
+=================
+
+Contents:
+
+.. toctree::
+   :maxdepth: 2
+
+   log.rst
+   config.rst
+   eval_timing.rst
+
+.. automodule:: moe.config
+
+.. Indices and tables
+   ==================
+
+.. * :ref:`genindex`
+   * :ref:`modindex`
+   * :ref:`search`
+
diff --git a/t/doc/log.rst b/t/doc/log.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c25ded4
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,11 @@
+Moe Logging
+===========
+
+One `Loggers` object is created for Eval, initializing 4 subloggers (see class description). 
+
+Use as `e.log.debug(...)` for both test and main log, `e.log.user.debug(...)` for `user` and other logs.
+
+.. autoclass:: moe.log.Loggers
+       :members:
+       :member-order: bysource
+
index 813976c3980f756bc41306e769b6520d4e0cb523..f24e1ef8f357748b41b13f2b8cff20419cfb90d7 100644 (file)
@@ -1,25 +1,22 @@
 """
 config.py
--------
+---------
 
 Lazy conditional string evaluation module for Moe configuration variables.
 
 
 * Each variable has ordered list of operations (definitions), each defining operation either 
-assigns (SET) or appends (APPEND) value of an expression to the variable. Each operation may be guarded by condition(s). 
-
-NOTE: If no 'SET' applies, a variable is still undefined even if some 'APPEND' applies. This might change.
+  assigns (SET) or appends (APPEND) value of an expression to the variable. Each operation may be guarded by condition(s). 
 
 * Each condition is a formula (tree consisting of 'AND', 'OR', 'NOT' and '==', '!=' between two expressions.
 
 * Expression is a list of strings and variables to be expanded.
 
-NOTE: All expanded data should be (or is converted to) unicode 
-
-
-TODO (OPT): Cleanup of unused undefined variables.
-TODO (OPT): Better variable name checking (no name '.'-structural prefix of another)
-TODO (OPT): Implemet "subtree" listing.
+.. note:: If no 'SET' applies, a variable is still undefined even if some 'APPEND' applies. This might change.
+.. note:: All expanded data should be (or is converted to) unicode 
+.. todo:: (OPT) Cleanup of unused undefined variables.
+.. todo:: (OPT) Better variable name checking (no name '.'-structural prefix of another)
+.. todo:: (OPT) Implemet "subtree" listing.
 """
 
 import types, itertools, re, bisect
@@ -159,9 +156,11 @@ class ConfigElem(object):
 class ConfigCondition(ConfigElem):
   """
   Condition using equality and logic operators.
-  Clause is a tuple-tree in the following recursive form:
-  ('AND', c1, c1), ('OR', c1, c2), ('NOT', c1), 
-  ('==', e1, e2), ('!=', e1, e2) where e1, e2 are `ConfigExpression`s.
+  Clause is a tuple-tree in the following recursive form::
+    
+    ('AND', c1, c1), ('OR', c1, c2), ('NOT', c1), ('==', e1, e2), ('!=', e1, e2) 
+    
+  where e1, e2 are `ConfigExpression`, c1, c2, `ConfigCondition`.
   """
 
   def __init__(self, formula, text=None, parent=None):
index 73b5406cbd6433e62712bde7b6b2f7f8717d3ae4..217cd9177a5003cbea0a05d540eab0e2f2052e83 100644 (file)
@@ -1,47 +1,44 @@
-"""
+r"""
 config_parser.py
-------------
+----------------
 
 Simple Moe configuration file syntax parser. 
 
-TODO: decide neccessity of '()' in/around formulas
-TODO: check escaping in expressions
-TODO: should whitespace (incl. '\\n') be allowed (almost) everywhere?
-      can comment be anywhere whitespace can?
-
 Generally, whitespace and comments are alowed everywhere except in variable names and inside expressions. 
-Also, COMMENT must not contain '\\n'. 
+Also, COMMENT must not contain '\n'. 
 
-FILE, BLOCK, STATEMENT, OPERATION, SUBTREE, CONDITION, FORMULA, AND, OR and NOT eat any preceding whitespace. TODO: check?
+FILE, BLOCK, STATEMENT, OPERATION, SUBTREE, CONDITION, FORMULA, AND, OR and NOT eat any preceding whitespace. 
 
-The configuration syntax is the following:
+The configuration syntax is the following::
 
-FILE = BLOCK 
-BLOCK = WS | STATEMENT ( SEP STATEMENT )* 
+    FILE = BLOCK 
+    BLOCK = WS | STATEMENT ( SEP STATEMENT )* 
 
-SEP = ( '\\n' | ';' )
-WS = ( ' ' | '\\t' | '\\n' | COMMENT )*
+    SEP = ( '\n' | ';' )
+    WS = ( ' ' | '\t' | '\n' | COMMENT )*
 
-COMMENT = re('#[^\\n]*\\n')
+    COMMENT = re('#[^\n]*\n')
 
-STATEMENT = CONDITION | OPERATION | SUBTREE
+    STATEMENT = CONDITION | OPERATION | SUBTREE
 
-OPERATION = WS VARNAME WS ( '=' | '+=' ) WS EXPRESSION
-SUBTREE = WS VARNAME WS '{' BLOCK WS '}'
-CONDITION = WS 'if' FORMULA WS '{' BLOCK WS '}'
+    OPERATION = WS VARNAME WS ( '=' | '+=' ) WS EXPRESSION
+    SUBTREE = WS VARNAME WS '{' BLOCK WS '}'
+    CONDITION = WS 'if' FORMULA WS '{' BLOCK WS '}'
 
-FORMULA = WS (( EXPRESSION WS ( '!=' | '==' ) WS EXPRESSION ) | '(' AND WS ')' | '(' OR WS ')' | NOT )
-AND = FORMULA WS 'and' FORMULA
-OR = FORMULA WS 'or' FORMULA
-NOT = WS 'not' FORMULA 
+    FORMULA = WS (( EXPRESSION WS ( '!=' | '==' ) WS EXPRESSION ) | '(' AND WS ')' | '(' OR WS ')' | NOT )
+    AND = FORMULA WS 'and' FORMULA
+    OR = FORMULA WS 'or' FORMULA
+    NOT = WS 'not' FORMULA 
 
-NOTE: ';' or '\n' is currently required even after CONDITION and SUBTREE block 
-  TODO: change to OPERATION only
-NOTE: Formula may contain additional/extra parentheses
+    EXPRESSION = '"' ( ECHAR | '{' VARNAME '}' )* '"' | re"'[^'\n]*'" | VARNAME
+    ECHAR = re('([^\{}]|\\|\{|\}|\\n)*')
+    VARNAME = re('[a-zA-Z0-9-_]+(\.[a-zA-Z0-9-_]+)*')
 
-EXPRESSION = '"' ( ECHAR | '{' VARNAME '}' )* '"' | re"'[^'\\n]*'" | VARNAME
-ECHAR = re('([^\\{}]|\\\\|\\{|\\}|\\n)*')
-VARNAME = re('[a-zA-Z0-9-_]+(\.[a-zA-Z0-9-_]+)*')
+.. todo:: should whitespace (incl. '\n') be allowed (almost) everywhere? 
+         can comment be anywhere whitespace can?
+.. note:: ';' or '\n' is currently required even after CONDITION and SUBTREE block 
+.. todo:: change to OPERATION only
+.. note:: Formula can contain additional/unnecessary parentheses
 """
 
 import re, types, itertools, logging as log