%%% Hlavní soubor. Zde se definují základní parametry a odkazuje se na ostatní části. %%%

% Meta-data o práci (je nutno upravit)
\input metadata.tex

% Vygenerujeme metadata ve formátu XMP pro použití balíčkem pdfx
\input xmp.tex

%% Verze pro jednostranný tisk:
% Okraje: levý 40mm, pravý 25mm, horní a dolní 25mm
% (ale pozor, LaTeX si sám přidává 1in)
\documentclass[12pt,a4paper]{report}
\setlength\textwidth{145mm}
\setlength\textheight{247mm}
\setlength\oddsidemargin{15mm}
\setlength\evensidemargin{15mm}
\setlength\topmargin{0mm}
\setlength\headsep{0mm}
\setlength\headheight{0mm}
% \openright zařídí, aby následující text začínal na pravé straně knihy
\let\openright=\clearpage

%% Pokud tiskneme oboustranně:
% \documentclass[12pt,a4paper,twoside,openright]{report}
% \setlength\textwidth{145mm}
% \setlength\textheight{247mm}
% \setlength\oddsidemargin{14.2mm}
% \setlength\evensidemargin{0mm}
% \setlength\topmargin{0mm}
% \setlength\headsep{0mm}
% \setlength\headheight{0mm}
% \let\openright=\cleardoublepage

%% Vytváříme PDF/A-2u
\usepackage[a-2u]{pdfx}

%% Přepneme na českou sazbu a fonty Latin Modern
\usepackage[czech]{babel}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{textcomp}

%% Použité kódování znaků: moderní TeXy používají UTF-8
\usepackage[utf8]{inputenc}

%%% Další užitečné balíčky (jsou součástí běžných distribucí LaTeXu)
\usepackage{amsmath}        % rozšíření pro sazbu matematiky
\usepackage{amsfonts}       % matematické fonty
\usepackage{amsthm}         % sazba vět, definic apod.
\usepackage{bm}             % tučné symboly (příkaz \bm)
\usepackage{booktabs}       % lepší vodorovné linky v tabulkách
\usepackage{caption}        % umožní definovat vlastní popisky plovoucích objektů
\usepackage{dcolumn}        % vylepšené zarovnání sloupců tabulek
\usepackage{floatrow}       % umožní definovat vlastní typy plovoucích objektů
\usepackage{graphicx}       % vkládání obrázků
\usepackage{icomma}         % inteligetní čárka v matematickém módu
\usepackage{indentfirst}    % zavede odsazení 1. odstavce kapitoly
\usepackage{microtype}      % mikrotypografická rozšíření
\usepackage{paralist}       % lepší enumerate a itemize
\usepackage[nottoc]{tocbibind} % zajistí přidání seznamu literatury,
                            % obrázků a tabulek do obsahu
\usepackage{xcolor}         % barevná sazba

% Balíček hyperref, kterým jdou vyrábět klikací odkazy v PDF,
% ale hlavně ho používáme k uložení metadat do PDF (včetně obsahu).
% Většinu nastavítek přednastaví balíček pdfx.
\hypersetup{unicode}
\hypersetup{breaklinks=true}

% Balíčky pro sazbu informatických prací
\usepackage{algpseudocode}
\usepackage{algorithm}
\usepackage{fancyvrb}       % vylepšené prostředí verbatim
\usepackage{listings}       % zvýrazňování syntaxe zdrojových textů

% Definice různých užitečných maker (viz popis uvnitř souboru)
\input macros.tex

%%% Set up bibliography formatting
% FIXME: Translate to Czech
% CHECK THE REQUIREMENTS OF YOUR DEPARTMENT AND FACULTY ON THE CITATION FORMAT!
%
% These are relatively "safe" default options that most people use:
%\usepackage[natbib,style=numeric,sorting=none]{biblatex}
% alternative with alphanumeric citations (more informative than numbers, and
% more common in computer science journals):
%\usepackage[natbib,style=alphabetic]{biblatex}
%
% ALTERNATIVES THAT CONFORM TO ISO 690
% ISO 690 is not the greatest citation format ever, but may be formally
% required at Charles University, depending on your faculty and department.
\usepackage[natbib,style=iso-numeric,sorting=none]{biblatex}
%\usepackage[natbib,style=iso-alphabetic]{biblatex}
% You might want to add extra options such as `maxbibnames=6,maxcitenames=2`
% here to further conform to some of the formatting requirements (see below for
% details). Again, consult your faculty rules.
%
% Additional option choices:
%  - add `giveninits=true` to typeset "E. A. Poe" instead of full Edgar Allan
%  - `terseinits=true` additionaly shortens it to nature-like "Poe EA"
%  - add `maxnames=10` to limit (or loosen) the maximum number of authors in
%    bibliography entry before shortening to `et al.` (useful when referring to
%    book collections that may have hundreds of authors)
%  - use `maxcitenames=2` to finetune the amount of authors listed in text-cite
%    commands (\citet). Corresponding option that only affects the bibliography
%    is `maxbibnames=10`.
%  - `sorting=none` causes the bibliography list to be ordered by the order of
%    citation as they appear in the text, which is usually the desired behavior
%    with numeric citations. Additionally you can use a style like
%    `numeric-comp` that compresses the long lists of citations such as
%    [1,2,3,4,5,6,7,8] to simpler [1--8]. This is especially useful if you plan
%    to add tremendous amounts of citations, as usual in life sciences and
%    bioinformatics.
%  - if you don't like the "In:" appearing in the bibliography, use the
%    extended style (`ext-numeric` or `ext-alphabetic`), and add option
%    `articlein=false`.
%
% Possibly reverse the names of the authors with the non-ISO styles:
%\DeclareNameAlias{default}{family-given}
%
% Use caps-and-small-caps for family names in ISO 690 style.
\let\familynameformat=\textsc

% Load the file with bibliography entries
\addbibresource{literatura.bib}

%%% Titulní strana a různé povinné informační strany
\begin{document}
\include{title}

%%% Strana s automaticky generovaným obsahem práce

\tableofcontents

%%% Jednotlivé kapitoly práce jsou pro přehlednost uloženy v samostatných souborech
\include{uvod}
\include{kap01}
\include{kap02}
\include{kap03}
\include{kap04}

\include{zaver}

%%% Seznam použité literatury
\include{literatura}

%%% Obrázky v práci
%%% (pokud jich je malé množství, obvykle není třeba seznam uvádět)
\listoffigures

%%% Tabulky v práci (opět nemusí být nutné uvádět)
%%% U matematických prací může být lepší přemístit seznam tabulek na začátek práce.
\listoftables

%%% Použité zkratky v práci (opět nemusí být nutné uvádět)
%%% U matematických prací může být lepší přemístit seznam zkratek na začátek práce.
\chapwithtoc{Seznam použitých zkratek}

%%% Součástí doktorských prací musí být seznam vlastních publikací
\ifx\ThesisType\TypePhD
\chapwithtoc{Seznam publikací}
\fi

%%% Přílohy k práci, existují-li. Každá příloha musí být alespoň jednou
%%% odkazována z vlastního textu práce. Přílohy se číslují.
%%%
%%% Do tištěné verze se spíše hodí přílohy, které lze číst a prohlížet (dodatečné
%%% tabulky a grafy, různé textové doplňky, ukázky výstupů z počítačových programů,
%%% apod.). Do elektronické verze se hodí přílohy, které budou spíše používány
%%% v elektronické podobě než čteny (zdrojové kódy programů, datové soubory,
%%% interaktivní grafy apod.). Elektronické přílohy se nahrávají do SISu a lze
%%% je také do práce vložit na CD/DVD. Povolené formáty souborů specifikuje
%%% opatření rektora č. 72/2017.
\appendix
\chapter{Přílohy}

\section{První příloha}

\openright
\end{document}
