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1 \ifx\endpart\undefined
2 \input macros.tex
3 \fi
4
5 \chapter{Advanced MST Algorithms}
6
7 \section{Minor-closed graph classes}\id{minorclosed}%
8
9 The contractive algorithm given in section~\ref{contalg} has been found to perform
10 well on planar graphs, but in the general case its time complexity was not linear.
11 Can we find any broader class of graphs where the algorithm is still efficient?
12 The right context turns out to be the minor-closed graph classes, which are
13 closed under contractions and have bounded density.
14
15 \defn\id{minordef}%
16 A~graph~$H$ is a \df{minor} of a~graph~$G$ (written as $H\minorof G$) iff it can be obtained
17 from a~subgraph of~$G$ by a sequence of simple graph contractions (see \ref{simpcont}).
18
19 \defn
20 A~class~$\cal C$ of graphs is \df{minor-closed}, when for every $G\in\cal C$ and
21 its every minor~$H$, the graph~$H$ lies in~$\cal C$ as well. A~class~$\cal C$ is called
22 \df{non-trivial} if at least one graph lies in~$\cal C$ and at least one lies outside~$\cal C$.
23
24 \example
25 Non-trivial minor-closed classes include:
26 \itemize\ibull
27 \:planar graphs,
28 \:graphs embeddable in any fixed surface (i.e., graphs of bounded genus),
29 \:graphs embeddable in~${\bb R}^3$ without knots or without interlocking cycles,
30 \:graphs of bounded tree-width or path-width.
31 \endlist
32
33 \para
34 Many of the nice structural properties of planar graphs extend to
35 minor-closed classes, too (see \cite{lovasz:minors} for a~nice survey
36 of this theory and \cite{diestel:gt} for some of the deeper results).
37 The most important property is probably the characterization
38 of such classes in terms of their forbidden minors.
39
40 \defn
41 For a~class~$\cal H$ of graphs we define $\Forb({\cal H})$ as the class
42 of graphs which do not contain any of the graphs in~$\cal H$ as a~minor.
43 We will call $\cal H$ the set of \df{forbidden (or excluded) minors} for this class.
44 We will often abbreviate $\Forb(\{M_1,\ldots,M_n\})$ to $\Forb(M_1,\ldots,M_n)$.
45
46 \obs
47 For every~${\cal H}\ne\emptyset$, the class $\Forb({\cal H})$ is non-trivial
48 and closed on minors. This works in the opposite direction as well: for every
49 minor-closed class~$\cal C$ there is a~class $\cal H$ such that ${\cal C}=\Forb({\cal H})$.
50 One such~$\cal H$ is the complement of~$\cal C$, but smaller ones can be found, too.
51 For example, the planar graphs can be equivalently described as the class $\Forb(K_5, K_{3,3})$
52 --- this follows from the Kuratowski's theorem (the theorem speaks of forbidden
53 subdivisions, but while in general this is not the same as forbidden minors, it
54 is for $K_5$ and $K_{3,3}$). The celebrated theorem by Robertson and Seymour
55 guarantees that we can always find a~finite set of forbidden minors.
56
57 \thmn{Excluded minors, Robertson \& Seymour \cite{rs:wagner}}
58 For every non-trivial minor-closed graph class~$\cal C$ there exists
59 a~finite set~$\cal H$ of graphs such that ${\cal C}=\Forb({\cal H})$.
60
61 \proof
62 This theorem has been proven in a~long series of papers on graph minors
63 culminating with~\cite{rs:wagner}. See this paper and follow the references
64 to the previous articles in the series.
65 \qed
66
67 \para
68 For analysis of the contractive algorithm,
69 we will make use of another important property --- the bounded density of
70 minor-closed classes. The connection between minors and density dates back to
71 Mader in the 1960's and it can be proven without use of the Robertson-Seymour
72 theorem.
73
74 \defn\id{density}%
75 Let $\cal C$ be a class of graphs. We define its \df{edge density} $\varrho(\cal C)$
76 to be the infimum of all~$\varrho$'s such that $m(G) \le \varrho\cdot n(G)$
77 holds for every $G\in\cal C$.
78
79 \thmn{Mader \cite{mader:dens}}
80 For every $k\in{\bb N}$ there exists $h(k)\in{\bb R}$ such that every graph
81 of average degree at least~$h(k)$ contains a~subdivision of~$K_{k}$ as a~subgraph.
82
83 \proofsketch
84 (See Lemma 3.5.1 in \cite{diestel:gt} for a~complete proof in English.)
85
86 Let us fix~$k$ and prove by induction on~$m$ that every graph of average
87 degree at least~$2^m$ contains a~subdivision of some graph with $k$~vertices
88 and ${k\choose 2}\ge m\ge k$~edges. For $m={k\choose 2}$ the theorem follows
89 as the only graph with~$k$ vertices and~$k\choose 2$ edges is~$K_k$.
90
91 The base case $m=k$: Let us observe that when the average degree
92 is~$a$, removing any vertex of degree less than~$a/2$ does not decrease the
93 average degree. A~graph with $a\ge 2^k$ therefore has a~subgraph
94 with minimum degree $\delta\ge a/2=2^{k-1}$. Such subgraph contains
95 a~cycle on more than~$\delta$ vertices, in other words a~subdivision of
96 the cycle~$C_k$.
97
98 Induction step: Let~$G$ be a~graph with average degree at least~$2^m$ and
99 assume that the theorem already holds for $m-1$. Without loss of generality,
100 $G$~is connected. Consider a~maximal set $U\subseteq V$ such that the subgraph $G[U]$
101 induced by~$U$ is connected and the graph $G.U$ ($G$~with $U$~contracted to
102 a~single vertex) has average degree at least~$2^m$ (such~$U$ exists, because
103 $G=G.U$ whenever $\vert U\vert=1$). Now consider the subgraph~$H$ induced
104 in~$G$ by the neighbors of~$U$. Every $v\in V(H)$ must have $\deg_H(v) \ge 2^{m-1}$,
105 as otherwise we can add this vertex to~$U$, contradicting its
106 maximality. By the induction hypothesis, $H$ contains a~subdivision of some
107 graph~$R$ with $r$~vertices and $m-1$ edges. Any two non-adjacent vertices
108 of~$R$ can be connected in the subdivision by a~path lying entirely in~$G[U]$,
109 which reveals a~subdivision of a~graph with $m$~edges. \qed
110
111 \thmn{Density of minor-closed classes, Mader~\cite{mader:dens}}
112 Every non-trivial minor-closed class of graphs has finite edge density.
113
114 \proof
115 Let~$\cal C$ be any such class, $X$~its smallest excluded minor and $x=n(X)$.
116 As $H\minorof K_x$, the class $\cal C$ entirely lies in ${\cal C}'=\Forb(K_x)$, so
117 $\varrho({\cal C}) \le \varrho({\cal C}')$ and therefore it suffices to prove the
118 theorem for classes excluding a~single complete graph~$K_x$.
119
120 We will show that $\varrho({\cal C})\le 2h(x)$, where $h$~is the function
121 from the previous theorem. If any $G\in{\cal C}$ had more than $2h(x)\cdot n(G)$
122 edges, its average degree would be at least~$h(x)$, so by the previous theorem
123 $G$~would contain a~subdivision of~$K_x$ and hence $K_x$ as a~minor.
124 \qed
125
126 \rem
127 Minor-closed classes share many other interesting properties, as shown for
128 example by Theorem 6.1 of \cite{nesetril:minors}.
129
130 \thmn{MST on minor-closed classes \cite{mm:mst}}\id{mstmcc}%
131 For any fixed non-trivial minor-closed class~$\cal C$ of graphs, the Contractive Bor\o{u}vka's
132 algorithm (\ref{contbor}) finds the MST of any graph of this class in time
133 $\O(n)$. (The constant hidden in the~$\O$ depends on the class.)
134
135 \proof
136 Following the proof for planar graphs (\ref{planarbor}), we denote the graph considered
137 by the algorithm at the beginning of the $i$-th iteration by~$G_i$ and its number of vertices
138 and edges by $n_i$ and $m_i$ respectively. Again the $i$-th phase runs in time $\O(m_i)$
139 and $n_i \le n/2^i$, so it remains to show a linear bound for the $m_i$'s.
140
141 Since each $G_i$ is produced from~$G_{i-1}$ by a sequence of edge contractions,
142 all $G_i$'s are minors of~$G$.\foot{Technically, these are multigraph contractions,
143 but followed by flattening, so they are equivalent to contractions on simple graphs.}
144 So they also belong to~$\cal C$ and by the previous theorem $m_i\le \varrho({\cal C})\cdot n_i$.
145 \qed
146
147 \rem\id{nobatch}%
148 The contractive algorithm uses ``batch processing'' to perform many contractions
149 in a single step. It is also possible to perform contractions one edge at a~time,
150 batching only the flattenings. A~contraction of an edge~$uv$ can be done
151 in time~$\O(\deg(u))$ by removing all edges incident with~$u$ and inserting them back
152 with $u$ replaced by~$v$. Therefore we need to find a lot of vertices with small
153 degrees. The following lemma shows that this is always the case in minor-closed
154 classes.
155
156 \lemman{Low-degree vertices}\id{lowdeg}%
157 Let $\cal C$ be a graph class with density~$\varrho$ and $G\in\cal C$ a~graph
158 with $n$~vertices. Then at least $n/2$ vertices of~$G$ have degree at most~$4\varrho$.
159
160 \proof
161 Assume the contrary: Let there be at least $n/2$ vertices with degree
162 greater than~$4\varrho$.  Then $\sum_v \deg(v) > n/2
163 \cdot 4\varrho = 2\varrho n$, which is in contradiction with the number
164 of edges being at most $\varrho n$.
165 \qed
166
167 \rem
168 The proof can be also viewed
169 probabilistically: let $X$ be the degree of a vertex of~$G$ chosen uniformly at
170 random. Then ${\bb E}X \le 2\varrho$, hence by the Markov's inequality
171 ${\rm Pr}[X > 4\varrho] < 1/2$, so for at least $n/2$ vertices~$v$ we have
172 $\deg(v)\le 4\varrho$.
173
174 \algn{Local Bor\o{u}vka's Algorithm \cite{mm:mst}}%
175 \algo
176 \algin A~graph~$G$ with an edge comparison oracle and a~parameter~$t\in{\bb N}$.
177 \:$T\=\emptyset$.
178 \:$\ell(e)\=e$ for all edges~$e$.
179 \:While $n(G)>1$:
180 \::While there exists a~vertex~$v$ such that $\deg(v)\le t$:
181 \:::Select the lightest edge~$e$ incident with~$v$.
182 \:::Contract~$G$ along~$e$.
183 \:::$T\=T + \ell(e)$.
184 \::Flatten $G$, removing parallel edges and loops.
185 \algout Minimum spanning tree~$T$.
186 \endalgo
187
188 \thm
189 When $\cal C$ is a minor-closed class of graphs with density~$\varrho$, the
190 Local Bor\o{u}vka's Algorithm with the parameter~$t$ set to~$4\varrho$ 
191 finds the MST of any graph from this class in time $\O(n)$. (The constant
192 in the~$\O$ depends on~the class.)
193
194 \proof
195 Let us denote by $G_i$, $n_i$ and $m_i$ the graph considered by the
196 algorithm at the beginning of the $i$-th iteration of the outer loop,
197 and the number of its vertices and edges respectively. As in the proof
198 of the previous algorithm (\ref{mstmcc}), we observe that all the $G_i$'s
199 are minors of the graph~$G$ given as the input.
200
201 For the choice $t=4\varrho$, the Lemma on low-degree vertices (\ref{lowdeg})
202 guarantees that at the beginning of the $i$-th iteration, at least $n_i/2$ vertices
203 have degree at most~$t$. Each selected edge removes one such vertex and
204 possibly increases the degree of another, so at least $n_i/4$ edges get selected.
205 Hence $n_i\le 3/4\cdot n_{i-1}$ and therefore $n_i\le n\cdot (3/4)^i$ and the
206 algorithm terminates after $\O(\log n)$ iterations.
207
208 Each selected edge belongs to $\mst(G)$, because it is the lightest edge of
209 the trivial cut $\delta(v)$ (see the Blue Rule in \ref{rbma}).
210 The steps 6 and~7 therefore correspond to the operation
211 described by the Lemma on contraction of MST edges (\ref{contlemma}) and when
212 the algorithm stops, $T$~is indeed the minimum spanning tree.
213
214 It remains to analyse the time complexity of the algorithm. Since $G_i\in{\cal C}$, we have
215 $m_i\le \varrho n_i \le \varrho n/2^i$.
216 We will show that the $i$-th iteration is carried out in time $\O(m_i)$.
217 Steps 5 and~6 run in time $\O(\deg(v))=\O(t)$ for each~$v$, so summed
218 over all $v$'s they take $\O(tn_i)$, which is linear for a fixed class~$\cal C$.
219 Flattening takes $\O(m_i)$, as already noted in the analysis of the Contracting
220 Bor\o{u}vka's Algorithm (see \ref{contiter}).
221
222 The whole algorithm therefore runs in time $\O(\sum_i m_i) = \O(\sum_i n/2^i) = \O(n)$.
223 \qed
224
225 \rem
226 For planar graphs, we can get a sharper version of the low-degree lemma,
227 showing that the algorithm works with $t=8$ as well (we had $t=12$ as
228 $\varrho=3$). While this does not change the asymptotic time complexity
229 of the algorithm, the constant-factor speedup can still delight the hearts of
230 its practical users.
231
232 \lemman{Low-degree vertices in planar graphs}%
233 Let $G$ be a planar graph with $n$~vertices. Then at least $n/2$ vertices of~$v$
234 have degree at most~8.
235
236 \proof
237 It suffices to show that the lemma holds for triangulations (if there
238 are any edges missing, the situation can only get better) with at
239 least 3 vertices. Since $G$ is planar, $\sum_v \deg(v) < 6n$.
240 The numbers $d(v):=\deg(v)-3$ are non-negative and $\sum_v d(v) < 3n$,
241 so by the same argument as in the proof of the general lemma, for at least $n/2$
242 vertices~$v$ it holds that $d(v) < 6$, hence $\deg(v) \le 8$.
243 \qed
244
245 \rem\id{hexa}%
246 The constant~8 in the previous lemma is the best we can have.
247 Consider a $k\times k$ triangular grid. It has $n=k^2$ vertices, $\O(k)$ of them
248 lie on the outer face and have degrees at most~6, the remaining $n-\O(k)$ interior
249 vertices have degree exactly~6. Therefore the number of faces~$f$ is $6/3\cdot n=2n$,
250 ignoring terms of order $\O(k)$. All interior triangles can be properly colored with
251 two colors, black and white. Now add a~new vertex inside each white face and connect
252 it to all three vertices on the boundary of that face. This adds $f/2 \approx n$
253 vertices of degree~3 and it increases the degrees of the original $\approx n$ interior
254 vertices to~9, therefore about a half of the vertices of the new planar graph
255 has degree~9.
256
257 \figure{hexangle.eps}{\epsfxsize}{The construction from Remark~\ref{hexa}}
258
259 \rem
260 The observation in~Theorem~\ref{mstmcc} was also made by Gustedt in~\cite{gustedt:parallel},
261 who studied a~parallel version of the contractive Bor\o{u}vka's algorithm applied
262 to minor-closed classes.
263
264 %--------------------------------------------------------------------------------
265
266 \section{Using Fibonacci heaps}
267 \id{fibonacci}
268
269 We have seen that the Jarn\'\i{}k's Algorithm \ref{jarnik} runs in $\Theta(m\log n)$ time.
270 Fredman and Tarjan have shown a~faster implementation in~\cite{ft:fibonacci}
271 using their Fibonacci heaps. In this section, we convey their results and we
272 show several interesting consequences.
273
274 The previous implementation of the algorithm used a binary heap to store all edges
275 separating the current tree~$T$ from the rest of the graph, i.e., edges of the cut~$\delta(T)$.
276 Instead of that, we will remember the vertices adjacent to~$T$ and for each such vertex~$v$ we
277 will maintain the lightest edge~$uv$ such that $u$~lies in~$T$. We will call these edges \df{active edges}
278 and keep them in a~Fibonacci heap, ordered by weight.
279
280 When we want to extend~$T$ by the lightest edge of~$\delta(T)$, it is sufficient to
281 find the lightest active edge~$uv$ and add this edge to~$T$ together with the new vertex~$v$.
282 Then we have to update the active edges as follows. The edge~$uv$ has just ceased to
283 be active. We scan all neighbors~$w$ of the vertex~$v$. When $w$~is in~$T$, no action
284 is needed. If $w$~is outside~$T$ and it was not adjacent to~$T$ (there is no active edge
285 remembered for it so far), we set the edge~$vw$ as active. Otherwise we check the existing
286 active edge for~$w$ and replace it by~$vw$ if the new edge is lighter.
287
288 The following algorithm shows how these operations translate to insertions, decreases
289 and deletions on the heap.
290
291 \algn{Active Edge Jarn\'\i{}k; Fredman and Tarjan \cite{ft:fibonacci}}\id{jarniktwo}%
292 \algo
293 \algin A~graph~$G$ with an edge comparison oracle.
294 \:$v_0\=$ an~arbitrary vertex of~$G$.
295 \:$T\=$ a tree containing just the vertex~$v_0$.
296 \:$H\=$ a~Fibonacci heap of active edges stored as pairs $(u,v)$ where $u\in T,v\not\in T$, ordered by the weights $w(uv)$, initially empty.
297 \:$A\=$ a~mapping of vertices outside~$T$ to their active edges in the heap; initially all elements undefined.
298 \:\<Insert> all edges incident with~$v_0$ to~$H$ and update~$A$ accordingly.
299 \:While $H$ is not empty:
300 \::$(u,v)\=\<DeleteMin>(H)$.
301 \::$T\=T+uv$.
302 \::For all edges $vw$ such that $w\not\in T$:
303 \:::If there exists an~active edge~$A(w)$:
304 \::::If $vw$ is lighter than~$A(w)$, \<Decrease> $A(w)$ to~$(v,w)$ in~$H$.
305 \:::If there is no such edge, then \<Insert> $(v,w)$ to~$H$ and set~$A(w)$.
306 \algout Minimum spanning tree~$T$.
307 \endalgo
308
309 \para
310 To analyze the time complexity of this algorithm, we will use the standard
311 theorem on~complexity of the Fibonacci heap:
312
313 \thmn{Fibonacci heaps} The~Fibonacci heap performs the following operations
314 with the indicated amortized time complexities:
315 \itemize\ibull
316 \:\<Insert> (insertion of a~new element) in $\O(1)$,
317 \:\<Decrease> (decreasing value of an~existing element) in $\O(1)$,
318 \:\<Merge> (merging of two heaps into one) in $\O(1)$,
319 \:\<DeleteMin> (deletion of the minimal element) in $\O(\log n)$,
320 \:\<Delete> (deletion of an~arbitrary element) in $\O(\log n)$,
321 \endlist
322 \>where $n$ is the number of elements present in the heap at the time of
323 the operation.
324
325 \proof
326 See Fredman and Tarjan \cite{ft:fibonacci} for both the description of the Fibonacci
327 heap and the proof of this theorem.
328 \qed
329
330 \thm
331 Algorithm~\ref{jarniktwo} with the Fibonacci heap finds the MST of the input graph in time~$\O(m+n\log n)$.
332
333 \proof
334 The algorithm always stops, because every edge enters the heap~$H$ at most once.
335 As it selects exactly the same edges as the original Jarn\'\i{}k's algorithm,
336 it gives the correct answer.
337
338 The time complexity is $\O(m)$ plus the cost of the heap operations. The algorithm
339 performs at most one \<Insert> or \<Decrease> per edge and exactly one \<DeleteMin>
340 per vertex. There are at most $n$ elements in the heap at any given time,
341 thus by the previous theorem the operations take $\O(m+n\log n)$ time in total.
342 \qed
343
344 \cor
345 For graphs with edge density at least $\log n$, this algorithm runs in linear time.
346
347 \rem
348 We can consider using other kinds of heaps which have the property that inserts
349 and decreases are faster than deletes. Of course, the Fibonacci heaps are asymptotically
350 optimal (by the standard $\Omega(n\log n)$ lower bound on sorting by comparisons, see
351 for example \cite{clrs}), so the other data structures can improve only
352 multiplicative constants or offer an~easier implementation.
353
354 A~nice example is a~\df{$d$-regular heap} --- a~variant of the usual binary heap
355 in the form of a~complete $d$-regular tree. \<Insert>, \<Decrease> and other operations
356 involving bubbling the values up spend $\O(1)$ time at a~single level, so they run
357 in~$\O(\log_d n)$ time. \<Delete> and \<DeleteMin> require bubbling down, which incurs
358 comparison with all~$d$ sons at every level, so they spend $\O(d\log_d n)$.
359 With this structure, the time complexity of the whole algorithm
360 is $\O(nd\log_d n + m\log_d n)$, which suggests setting $d=m/n$, yielding $\O(m\log_{m/n}n)$.
361 This is still linear for graphs with density at~least~$n^{1+\varepsilon}$.
362
363 Another possibility is to use the 2-3-heaps \cite{takaoka:twothree} or Trinomial
364 heaps \cite{takaoka:trinomial}. Both have the same asymptotic complexity as Fibonacci
365 heaps (the latter even in the worst case, but it does not matter here) and their
366 authors claim faster implementation. For integer weights, we can use Thorup's priority
367 queues described in \cite{thorup:pqsssp} which have constant-time \<Insert> and \<Decrease>
368 and $\O(\log\log n)$ time \<DeleteMin>. (We will however omit the details since we will
369 show a~faster integer algorithm soon.)
370
371 \para
372 As we already noted, the improved Jarn\'\i{}k's algorithm runs in linear time
373 for sufficiently dense graphs. In some cases, it is useful to combine it with
374 another MST algorithm, which identifies a~part of the MST edges and contracts
375 the graph to increase its density. For example, we can perform several
376 iterations of the Contractive Bor\o{u}vka's algorithm and find the rest of the
377 MST by the Active Edge Jarn\'\i{}k's algorithm.
378
379 \algn{Mixed Bor\o{u}vka-Jarn\'\i{}k}
380 \algo
381 \algin A~graph~$G$ with an edge comparison oracle.
382 \:Run $\log\log n$ iterations of the Contractive Bor\o{u}vka's algorithm (\ref{contbor}),
383   getting a~MST~$T_1$.
384 \:Run the Active Edge Jarn\'\i{}k's algorithm (\ref{jarniktwo}) on the resulting
385   graph, getting a~MST~$T_2$.
386 \:Combine $T_1$ and~$T_2$ to~$T$ as in the Contraction lemma (\ref{contlemma}).
387 \algout Minimum spanning tree~$T$.
388 \endalgo
389
390 \thm
391 The Mixed Bor\o{u}vka-Jarn\'\i{}k algorithm finds the MST of the input graph in time $\O(m\log\log n)$.
392
393 \proof
394 Correctness follows from the Contraction lemma and from the proofs of correctness of the respective algorithms.
395 As~for time complexity: The first step takes $\O(m\log\log n)$ time
396 (by Lemma~\ref{contiter}) and it gradually contracts~$G$ to a~graph~$G'$ of size
397 $m'\le m$ and $n'\le n/\log n$. The second step then runs in time $\O(m'+n'\log n') = \O(m)$
398 and both trees can be combined in linear time, too.
399 \qed
400
401 \para
402 Actually, there is a~much better choice of the algorithms to combine: use the
403 Active Edge Jarn\'\i{}k's algorithm multiple times, each time stopping after a~while.
404 A~good choice of the stopping condition is to place a~limit on the size of the heap.
405 We start with an~arbitrary vertex, grow the tree as usually and once the heap gets too large,
406 we conserve the current tree and start with a~different vertex and an~empty heap. When this
407 process runs out of vertices, it has identified a~sub-forest of the MST, so we can
408 contract the graph along the edges of~this forest and iterate.
409
410 \algn{Iterated Jarn\'\i{}k; Fredman and Tarjan \cite{ft:fibonacci}}
411 \algo
412 \algin A~graph~$G$ with an edge comparison oracle.
413 \:$T\=\emptyset$. \cmt{edges of the MST}
414 \:$\ell(e)\=e$ for all edges~$e$. \cmt{edge labels as usually}
415 \:$m_0\=m$.
416 \:While $n>1$: \cmt{We will call iterations of this loop \df{phases}.}
417 \::$F\=\emptyset$. \cmt{forest built in the current phase}
418 \::$t\=2^{\lceil 2m_0/n \rceil}$. \cmt{the limit on heap size}
419 \::While there is a~vertex $v_0\not\in F$:
420 \:::Run the Active Edge Jarn\'\i{}k's algorithm (\ref{jarniktwo}) from~$v_0$, stop when:
421 \::::all vertices have been processed, or
422 \::::a~vertex of~$F$ has been added to the tree, or
423 \::::the heap has grown to more than~$t$ elements.
424 \:::Denote the resulting tree~$R$.
425 \:::$F\=F\cup R$.
426 \::$T\=T\cup \ell[F]$. \cmt{Remember MST edges found in this phase.}
427 \::Contract~$G$ along all edges of~$F$ and flatten it.
428 \algout Minimum spanning tree~$T$.
429 \endalgo
430
431 \nota
432 For analysis of the algorithm, let us denote the graph entering the $i$-th
433 phase by~$G_i$ and likewise with the other parameters. Let the trees from which
434 $F_i$~has been constructed be called $R_i^1, \ldots, R_i^{z_i}$. The
435 non-indexed $G$, $m$ and~$n$ will correspond to the graph given as~input.
436
437 \para
438 However the choice of the parameter~$t$ can seem mysterious, the following
439 lemma makes the reason clear:
440
441 \lemma\id{ijphase}%
442 The $i$-th phase of the Iterated Jarn\'\i{}k's algorithm runs in time~$\O(m)$.
443
444 \proof
445 During the phase, the heap always contains at most~$t_i$ elements, so it takes
446 time~$\O(\log t_i)=\O(m/n_i)$ to delete an~element from the heap. The trees~$R_i^j$
447 are edge-disjoint, so there are at most~$n_i$ \<DeleteMin>'s over the course of the phase.
448 Each edge is considered at most twice (once per its endpoint), so the number
449 of the other heap operations is~$\O(m_i)$. Together, it equals $\O(m_i + n_i\log t_i) = \O(m_i+m) = \O(m)$.
450 \qed
451
452 \lemma
453 Unless the $i$-th phase is final, the forest~$F_i$ consists of at most $2m_i/t_i$ trees.
454
455 \proof
456 As every edge of~$G_i$ is incident with at most two trees of~$F_i$, it is sufficient
457 to establish that there are at least~$t_i$ edges incident with every such tree, including
458 connecting two vertices of the tree.
459
460 The forest~$F_i$ evolves by additions of the trees~$R_i^j$. Let us consider the possibilities
461 how the algorithm could have stopped growing the tree~$R_i^j$:
462 \itemize\ibull
463 \:the heap had more than~$t_i$ elements (step~10): since the each elements stored in the heap
464   corresponds to a~unique edges incident with~$R_i^j$, we have enough such edges;
465 \:the algorithm just added a~vertex of~$F_i$ to~$R_i^j$ (step~9): in this case, an~existing
466   tree of~$F_i$ is extended, so the number of edges incident with it cannot decrease;\foot{%
467   This is the place where we needed to count the interior edges as well.}
468 \:all vertices have been processed (step~8): this can happen only in the final phase.
469 \qeditem
470 \endlist
471
472 \thm\id{itjarthm}%
473 The Iterated Jarn\'\i{}k's algorithm finds the MST of the input graph in time
474 $\O(m\timesbeta(m,n))$, where $\beta(m,n):=\min\{ i: \log^{(i)}n \le m/n \}$.
475
476 \proof
477 Phases are finite and in every phase at least one edge is contracted, so the outer
478 loop is eventually terminated. The resulting subgraph~$T$ is equal to $\mst(G)$, because each $F_i$ is
479 a~subgraph of~$\mst(G_i)$ and the $F_i$'s are glued together according to the Contraction
480 lemma (\ref{contlemma}).
481
482 Let us bound the sizes of the graphs processed in the individual phases. As the vertices
483 of~$G_{i+1}$ correspond to the components of~$F_i$, by the previous lemma $n_{i+1}\le
484 2m_i/t_i$. Then $t_{i+1} = 2^{\lceil 2m/n_{i+1} \rceil} \ge 2^{2m/n_{i+1}} \ge 2^{2m/(2m_i/t_i)} = 2^{(m/m_i)\cdot t_i} \ge 2^{t_i}$,
485 therefore:
486 $$
487 \left. \vcenter{\hbox{$\displaystyle t_i \ge 2^{2^{\scriptstyle 2^{\scriptstyle\rddots^{\scriptstyle m/n}}}} $}}\;\right\}
488 \,\hbox{a~tower of~$i$ exponentials.}
489 $$
490 As soon as~$t_i\ge n$, the $i$-th phase must be final, because at that time
491 there is enough space in the heap to process the whole graph. So~there are
492 at most~$\beta(m,n)$ phases and we already know (Lemma~\ref{ijphase}) that each
493 phase runs in linear time.
494 \qed
495
496 \cor
497 The Iterated Jarn\'\i{}k's algorithm runs in time $\O(m\log^* n)$.
498
499 \proof
500 $\beta(m,n) \le \beta(1,n) = \log^* n$.
501 \qed
502
503 \cor
504 When we use the Iterated Jarn\'\i{}k's algorithm on graphs with edge density
505 at least~$\log^{(k)} n$ for some $k\in{\bb N}^+$, it runs in time~$\O(km)$.
506
507 \proof
508 If $m/n \ge \log^{(k)} n$, then $\beta(m,n)\le k$.
509 \qed
510
511 \obs
512 The algorithm spends most of the time in phases which have small heaps. Once the
513 heap grows to $\Omega(\log^{(k)} n)$ for any fixed~$k$, the graph gets dense enough
514 to guarantee that at most~$k$ phases remain. This means that if we are able to
515 construct a~heap of size $\Omega(\log^{(k)} n)$ with constant time per operation,
516 we can get a~linear-time algorithm for MST. This is the case when the weights are
517 integers:
518
519 \thmn{MST for graphs with integer weights, Fredman and Willard \cite{fw:transdich}}\id{intmst}%
520 MST of a~graph with integer edge weights can be found in time $\O(m)$ on the Word-RAM.
521
522 \proof
523 We will combine the Iterated Jarn\'\i{}k's algorithm with the Q-heaps from section \ref{qheaps}.
524 We modify the first pass of the algorithm to choose $t=\log n$ and use the Q-heap tree instead
525 of the Fibonacci heap. From Theorem \ref{qh} and Remark \ref{qhtreerem} we know that the
526 operations on the Q-heap tree run in constant time, so the modified first phase takes time~$\O(m)$.
527 Following the analysis of the original algorithm in the proof of Theorem \ref{itjarthm} we obtain
528 $t_2\ge 2^{t_1} = 2^{\log n} = n$, so the algorithm stops after the second phase.\foot{%
529 Alternatively, we can use the Q-heaps directly with $k=\log^{1/4}n$ and then stop
530 after the third phase.}
531 \qed
532
533 \rem
534 Gabow et al.~\cite{gabow:mst} have shown how to speed up the Iterated Jarn\'\i{}k's algorithm to~$\O(m\log\beta(m,n))$.
535 They split the adjacency lists of the vertices to small buckets, keep each bucket
536 sorted and consider only the lightest edge in each bucket until it is removed.
537 The mechanics of the algorithm is complex and there is a~lot of technical details
538 which need careful handling, so we omit the description of this algorithm.
539
540 \FIXME{Reference to Chazelle.}
541
542 %--------------------------------------------------------------------------------
543
544 \section{Verification of minimality}
545
546 Now we will turn our attention to a~slightly different problem: given a~spanning
547 tree, how to verify that it is minimum? We will show that this can be achieved
548 in linear time and it will serve as a~basis for a~randomized linear-time
549 MST algorithm in Section~\ref{randmst}.
550
551 MST verification has been studied by Koml\'os \cite{komlos:verify}, who has
552 proven that $\O(m)$ edge comparisons are sufficient, but his algorithm needed
553 superlinear time to find the edges to compare. Dixon, Rauch and Tarjan
554 have later shown in \cite{dixon:verify} that the overhead can be reduced
555 to linear time on the RAM using preprocessing and table lookup on small
556 subtrees. Later, King has given a~simpler algorithm in \cite{king:verifytwo}.
557
558 In this section, we will follow Koml\'os's steps and study the comparisons
559 needed, saving the actual efficient implementation for later.
560
561 \para
562 To verify that a~spanning~$T$ is minimum, it is sufficient to check that all
563 edges outside~$T$ are $T$-heavy (by Theorem \ref{mstthm}). In fact, we will be
564 able to find all $T$-light edges efficiently. For each edge $uv\in E\setminus T$,
565 we will find the heaviest edge of the tree path $T[u,v]$ and compare its weight
566 to $w(uv)$. It is therefore sufficient to solve the following problem:
567
568 \problem
569 Given a~weighted tree~$T$ and a~set of \df{query paths} $Q \subseteq \{ T[u,v] ; u,v\in V(T) \}$
570 specified by their endpoints, find the heaviest edge (\df{peak}) for every path in~$Q$.
571
572 \para
573 Finding the peaks can be burdensome if the tree~$T$ is degenerated,
574 so we will first reduce it to the same problem on a~balanced tree. We run
575 the Bor\o{u}vka's algorithm on~$T$, which certainly produces $T$ itself, and we
576 record the order in which the subtrees have been merged in another tree~$B(T)$.
577 The peak queries on~$T$ can be then easily translated to peak queries on~$B(T)$.
578
579 \defn
580 For a~weighted tree~$T$ we define its \df{Bor\o{u}vka tree} $B(T)$ as a~rooted tree which records
581 the execution of the Bor\o{u}vka's algorithm run on~$T$. The leaves of $B(T)$
582 are all the vertices of~$T$, an~internal vertex~$v$ at level~$i$ from the bottom
583 corresponds to a~component tree~$C(v)$ formed in the $i$-th phase of the algorithm. When
584 a~tree $C(v)$ selects an adjacent edge~$e$ and gets merged with some other trees to form
585 a~component $C(u)$, we add an~edge $uv$ to~$B(T)$ and set its weight to $w(e)$.
586
587 \figure{bortree.eps}{\epsfxsize}{An octipede and its Bor\o{u}vka tree}
588
589 \obs
590 As the algorithm finishes with a~single component in the last phase, the Bor\o{u}vka tree
591 is really a~tree. All its leaves are on the same level and each internal vertex has
592 at least two sons. Such trees will be called \df{complete branching trees.}
593
594 \lemma
595 For every tree~$T$ and every pair of its vertices $x,y\in V(T)$, the peak
596 of the path $T[x,y]$ has the same weight as the peak of~the path $B(T)[x,y]$.
597
598 \proof
599 Let us denote the path $T[x,y]$ by~$P$ and its heaviest edge by~$h=ab$. Similarly,
600 let us use $P'$ for $B(T)[x,y]$ and $h'$ for the heaviest edge of~$P'$.
601
602 We will first prove that~$h$ has its counterpart of the same weight in~$P'$,
603 so $w(h') \ge w(h)$. Consider the lowest vertex $u$ of~$B(T)$ such that the
604 component $C(u)$ contains both $a$ and~$b$, and consider the sons $v_a$ and $v_b$ of~$u$
605 for which $a\in C(v_a)$ and $b\in C(v_b)$. As the edge~$h$ must have been
606 selected by at least one of these components, we assume without loss of generality that
607 it was $C(v_a)$, and hence we have $w(uv_a)=w(h)$. We will show that the
608 edge~$uv_a$ lies in~$P'$, because exactly one of the endpoints of~$h$ lies
609 in~$C(v_a)$. Both endpoints cannot lie there, since it would imply that $C(v_a)$,
610 being connected, contains the whole path~$P$, including~$h$. On the other hand,
611 if $C(v_a)$ contained neither~$x$ nor~$y$, it would have to be incident with
612 another edge of~$P$ different from~$h$, so this lighter edge would be selected
613 instead of~$h$.
614
615 In the other direction: for any edge~$uv\in P'$, the tree~$C(v)$ is incident
616 with at least one edge of~$P$, so the selected edge must be lighter or equal
617 to this edge and hence also to~$h$.
618 \qed
619
620 \para
621 We will simplify the problem even further: For an~arbitrary tree~$T$, we split each
622 query path $T[x,y]$ to two half-paths $T[x,a]$ and $T[a,y]$ where~$a$ is the
623 \df{lowest common ancestor} of~$x$ and~$y$ in~$T$. It is therefore sufficient to
624 consider only paths which connect a~vertex with one of its ancestors.
625
626 When we combine the two transforms, we get:
627
628 \lemma\id{verbranch}%
629 For each tree~$T$ on $n$~vertices and a~set~$Q$ of $q$~query paths on~$T$, it is possible
630 to find a~complete branching tree~$T'$, together with a~set~$Q'$ of paths on~$T'$,
631 such that the weights of the heaviest edges of the paths in~$Q$ can be deduced from
632 the same of the paths in~$Q'$. The tree $T'$ has at most $2n$ vertices and $\O(\log n)$
633 levels. The set~$Q'$ contains at most~$2q$ paths and each of them connects a~vertex of~$T'$
634 with one of its ancestors. The construction of~$T'$ involves $\O(n)$ comparisons
635 and the transformation of the answers takes $\O(q)$ comparisons.
636
637 \proof
638 The tree~$T'$ will be the Bor\o{u}vka tree for~$T$, obtained by running the
639 contractive version of the Bor\o{u}vka's algorithm (Algorithm \ref{contbor})
640 on~$T$. The algorithm runs in linear time, for example because trees are planar
641 (Theorem \ref{planarbor}). We therefore spend $\O(n)$ comparisons in it.
642
643 As~$T'$ has~$n$ leaves and it is a~complete branching tree, it has at most~$n$ internal vertices,
644 so~$n(T')\le 2n$ as promised. Since the number of passes of the Bor\o{u}vka's
645 algorithm is $\O(\log n)$, the depth of the Bor\o{u}vka tree must be logarithmic as well.
646
647 For each query path $T[x,y]$ we find the lowest common ancestor of~$x$ and~$y$
648 and split the path by the two half-paths. This produces a~set~$Q'$ of at most~$2q$ half-paths.
649 The peak of every original query path is then the heavier of the peaks of its halves.
650 \qed
651
652 \para
653 We will now describe a~simple variant of the depth-first search which finds the
654 peaks of all query paths of the transformed problem. As we promised,
655 we will take care of the number of comparisons only, as long as all other operations
656 are well-defined and they can be performed in polynomial time.
657
658 \defn
659 For every edge~$e=uv$, we consider the set $Q_e$ of all query paths containing~$e$.
660 The vertex of a~path, which is closer to the root, will be called its \df{top,}
661 the other vertex its \df{bottom.}
662 We define arrays $T_e$ and~$P_e$ as follows: $T_e$ contains
663 the tops of the paths in~$Q_e$ in order of their increasing depth (we
664 will call them \df{active tops} and each of them will be stored exactly once). For
665 each active top~$t=T_e[i]$, we define $P_e[i]$ as the peak of the path $T[v,t]$.
666
667 \obs
668 As for every~$i$ the path $T[v,T_e[i+1]]$ is contained within $T[v,T_e[i]]$,
669 the edges of~$P_e$ must have non-increasing weights, that is $w(P_e[i+1]) \le
670 w(P_e[i])$.
671
672 \alg $\<FindHeavy>(u,p,T_p,P_p)$ --- process all queries in the subtree rooted
673 at~$u$ entered from its parent via an~edge~$p$.
674 \id{findheavy}
675
676 \algo
677 \:Process all query paths whose bottom is~$u$ and record their peaks.
678 This is accomplished by finding the index~$i$ of each path's top in~$T_p$ and reading
679 the desired edge from~$P_p[i]$.
680
681 \:For every son~$v$ of~$u$, process the edge $e=uv$:
682
683 \::Construct the array of tops~$T_e$ for the edge~$e$: Start with~$T_p$, remove
684    the tops of the paths which do not contain~$e$ and add the vertex~$u$ itself
685    if there is a~query path which has~$u$ as its top and which has bottom somewhere
686    in the subtree rooted at~$v$.
687
688 \::Construct the array of the peaks~$P_e$: Start with~$P_p$,
689    remove the entries corresponding to the tops which are no longer active.
690    Since the paths leading to all active tops have been extended by the
691    edge~$e$, compare $w(e)$ with weights of the edges recorded in~$P_e$ and replace
692    those edges which are lighter by~$e$.
693    Since $P_p$ was sorted, we can use binary search
694    to locate the boundary between lighter and heavier edges in~$P_e$. Finally
695    append~$e$ to the array if the top $u$ became active.
696
697 \::Recurse on~$v$: call $\<FindHeavy>(v,e,T_e,P_e)$.
698 \endalgo
699
700 \>As we need a~parent edge to start the recursion, we add an~imaginary parent
701 edge~$p_0$ of the root vertex~$r$, for which no queries are defined. We can
702 therefore start with $\<FindHeavy>(r,p_0,\emptyset,\emptyset)$.
703
704 Let us account for the comparisons:
705
706 \lemma\id{vercompares}%
707 When the procedure \<FindHeavy> is called on the transformed problem, it
708 performs $\O(n+q)$ comparisons, where $n$ is the size of the tree and
709 $q$ is the number of query paths.
710
711 \proof
712 We will calculate the number of comparisons~$c_i$ performed when processing the edges
713 going from the $(i+1)$-th to the $i$-th level of the tree.
714 The levels are numbered from the bottom, so leaves are at level~0 and the root
715 is at level $\ell\le \lceil \log_2 n\rceil$. There are $n_i\le n/2^i$ vertices
716 at the $i$-th level, so we consider exactly $n_i$ edges. To avoid taking a~logarithm
717 of zero, we define $\vert T_e\vert=1$ for $T_e=\emptyset$.
718 \def\eqalign#1{\null\,\vcenter{\openup\jot
719   \ialign{\strut\hfil$\displaystyle{##}$&$\displaystyle{{}##}$\hfil
720       \crcr#1\crcr}}\,}
721 $$\vcenter{\openup\jot\halign{\strut\hfil $\displaystyle{#}$&$\displaystyle{{}#}$\hfil&\quad#\hfil\cr
722 c_i &\le \sum_e \left( 1 + \log \vert T_e\vert \right)&(Total cost of the binary searches.)\cr
723     &\le n_i + \sum_e \log\vert T_e\vert&(We sum over $n_i$ edges.)\cr
724     &\le n_i + n_i \cdot {\sum_e \log\vert T_e\vert \over n_i}&(Consider the average of logarithms.) \cr
725     &\le n_i + n_i \cdot \log{\sum_e \vert T_e\vert \over n_i}&(Logarithm is concave.) \cr
726     &\le n_i + n_i \cdot \log{q+n\over n_i}&(Bound the number of tops by queries.) \cr
727     &= n_i \cdot \left( 1 + \log\left({q+n\over n}\cdot{n\over n_i}\right) \right)\cr
728     &= n_i + n_i\log{q+n\over n} + n_i\log{n\over n_i}.\cr
729 }}$$
730 Summing over all levels, we estimate the total number of comparisons as:
731 $$
732 c = \sum_i c_i = \left( \sum_i n_i \right) + \left( \sum_i n_i \log{q+n\over n}\right) + \left( \sum_i n_i \log{n\over n_i}\right).
733 $$
734 The first part is equal to~$n$, the second one to $n\log((q+n)/n)\le q+n$. For the third
735 one, we would like to plug in the bound $n_i \le n/2^i$, but we unfortunately have one~$n_i$
736 in the denominator. We save the situation by observing that the function $f(x)=x\log(n/x)$
737 is decreasing\foot{We can easily check the derivative: $f(x)=(x\ln n-x\ln x)/\ln 2$, so $f'(x)\cdot \ln2 =
738 \ln n - \ln x - 1$. We want $f'(x)<0$ and therefore $\ln x > \ln n - 1$, i.e., $x > n/e$.}
739 for $x > n/e$, so for $i\ge 2$ it holds that:
740 $$
741 n_i\log{n\over n_i} \le {n\over 2^i}\cdot\log{n\over n/2^i} = {n\over 2^i} \cdot i.
742 $$
743 We can therefore rewrite the third part as:
744 $$\eqalign{
745 \sum_i n_i\log{n\over n_i} &\le n_0\log{n\over n_0} + n_1\log{n\over n_1} + n\cdot\sum_{i\ge 2}{i\over 2^i} \le\cr
746 &\le n\log1 + n_1\cdot {n\over n_1} + n\cdot\O(1) = \O(n).\cr
747 }$$
748 Putting all three parts together, we conclude that:
749 $$
750 c \le n + (q+n) + \O(n) = \O(n+q). \qedmath
751 $$
752
753 \para
754 When we combine this lemma with the above reduction, we get the following theorem:
755
756 \thmn{Verification of the MST, Koml\'os \cite{komlos:verify}}\id{verify}%
757 For every weighted graph~$G$ and its spanning tree~$T$, it is sufficient to
758 perform $\O(m)$ comparisons of edge weights to determine whether~$T$ is minimum
759 and to find all $T$-light edges in~$G$.
760
761 \proof
762 We first transform the problem to finding all peaks of a~set
763 of query paths in~$T$ (these are exactly the paths covered by the edges
764 of $G\setminus T$). We use the reduction from Lemma \ref{verbranch} to get
765 an~equivalent problem with a~full branching tree and a~set of parent-descendant
766 paths. The reduction costs $\O(m+n)$ comparisons.
767 Then we run the \<FindHeavy> procedure (Algorithm \ref{findheavy}) to find
768 the tops of all query paths. According to Lemma \ref{vercompares}, this spends another $\O(m+n)$
769 comparisons. Since we (as always) assume that~$G$ is connected, $\O(m+n)=\O(m)$.
770 \qed
771
772 \rem
773 The problem of computing path maxima or minima in a~weighted tree has several other interesting
774 applications. One of them is computing minimum cuts separating given pairs of vertices in a~given
775 weighted undirected graph~$G$. We construct a~Gomory-Hu tree~$T$ for the graph as described in \cite{gomoryhu}
776 (see also \cite{bhalgat:ght} for a~more efficient algorithm running in time
777 $\widetilde\O(mn)$ for unit-cost graphs). The crucial property of this tree is that for every two
778 vertices $u$, $v$ of the graph~$G$, the minimum-cost edge on $T[u,v]$ has the same cost
779 as the minimum cut separating $u$ and~$v$ in~$G$. Since the construction of~$T$ generally
780 takes $\Omega(n^2)$ time, we could of course invest this time in precomputing the minima for
781 all pairs of vertices. This would however require quadratic space, so we can better use
782 the method of this section which fits in $\O(n+q)$ space for $q$~queries.
783
784 \rem
785 A~dynamic version of the problem is also often considered. It calls for a~data structure
786 representing a~weighted forest with operations for modifying the structure of the forest
787 and querying minima or maxima on paths. Sleator and Tarjan have shown in \cite{sleator:trees}
788 how to do this in $\O(\log n)$ time amortized per operation, which leads to
789 an~implementation of the Dinic's maximum flow algorithm \cite{dinic:flow}
790 in time $\O(mn\log n)$.
791
792 %--------------------------------------------------------------------------------
793
794 \section{Verification in linear time}
795
796 We have proven that $\O(m)$ edge weight comparisons suffice to verify minimality
797 of a~given spanning tree. In this section, we will show an~algorithm for the RAM,
798 which finds the required comparisons in linear time. We will follow the idea
799 of King from \cite{king:verify}, but as we have the power of the RAM data structures
800 from Section~\ref{bitsect} at our command, the low-level details will be easier,
801 especially the construction of vertex and edge labels.
802
803 \paran{Reduction}
804 First of all, let us make sure that the reduction to fully branching trees
805 in Lemma \ref{verbranch} can be made run in linear time. As already noticed
806 in the proof, the Bor\o{u}vka's algorithm runs in linear time. Constructing
807 the Bor\o{u}vka tree in the process adds at most a~constant overhead to every
808 step of the algorithm.
809
810 Finding the common ancestors is not trivial, but Harel and Tarjan have shown
811 in \cite{harel:nca} that linear time is sufficient on the RAM. Several more
812 accessible algorithms have been developed since then (see the Alstrup's survey
813 paper \cite{alstrup:nca} and a~particularly elegant algorithm shown by Bender
814 and Falach-Colton in \cite{bender:lca}). Any of them implies the following
815 theorem:
816
817 \thmn{Lowest common ancestors}\id{lcathm}%
818 On the RAM, it is possible to preprocess a~tree~$T$ in time $\O(n)$ and then
819 answer lowest common ancestor queries presented online in constant time.
820
821 \proof
822 See for example Bender and Falach-Colton \cite{bender:lca}.
823 \qed
824
825 \cor
826 The reductions in Lemma \ref{verbranch} can be performed in time $\O(m)$.
827
828 \para
829 Having the reduced problem at hand, we have to implement the procedure \<FindHeavy>
830 of Algorithm \ref{findheavy} efficiently. We need a~compact representation of
831 the arrays $T_e$ and~$P_e$ by vectors, so that the overhead of the algorithm
832 will be linear in the number of comparisons performed.
833
834 \defn
835
836 \em{Vertex identifiers:} Since all vertices referred to by the procedure
837 lie on the path from root to the current vertex~$u$, we modify the algorithm
838 to keep a~stack of these vertices in an~array and refer to each vertex by its
839 index in this array, i.e., by its depth. We will call these identifiers \df{vertex
840 labels} and we note that each label require only $\ell=\lceil \log\log n\rceil$
841 bits. As every tree edge is uniquely identified by its bottom vertex, we can
842 use the same encoding for \df{edge labels.}
843
844 \em{Slots:} As we will need several operations which are not computable
845 in constant time on the RAM, we precompute tables for these operations
846 like we did in the Q-Heaps (cf.~Lemma \ref{qhprecomp}). A~table for word-sized
847 arguments would take too much time to precompute, so we will generally store
848 our data structures in \df{slots} of $s=1/3\cdot\lceil\log n\rceil$ bits each.
849 We will show soon that it is possible to precompute a~table of any reasonable
850 function whose arguments fit in two slots.
851
852 \em{Top masks:} The array~$T_e$ will be represented by a~bit mask~$M_e$ called the \df{top mask.} For each
853 of the possible tops~$t$ (i.e., the ancestors of the current vertex), we store
854 a~single bit telling whether $t\in T_e$. Each top mask fits in $\lceil\log n\rceil$
855 bits and therefore in a~single machine word. If needed, it can be split to three slots.
856
857 \em{Small and big lists:} The heaviest edge found so far for each top is stored
858 by the algorithm in the array~$P_e$. Instead of keeping the real array,
859 we store the labels of these edges in a~list encoded in a~bit string.
860 Depending on the size of the list, we use two one of two possible encodings:
861 \df{Small lists} are stored in a~vector which fits in a~single slot, with
862 the unused fields filled by a~special constant, so that we can infer the
863 length of the list.
864
865 If the data do not fit in a~small list, we use a~\df{big list} instead, which
866 is stored in $\O(\log\log n)$ words, each of them containing a~slot-sized
867 vector. Unlike the small lists, we use the big lists as arrays. If a~top~$t$ of
868 depth~$d$ is active, we keep the corresponding entry of~$P_e$ in the $d$-th
869 field of the big list. Otherwise, we keep that entry unused.
870
871 We will want to perform all operations on small lists in constant time,
872 but we can afford spending time $\O(\log\log n)$ on every big list. This
873 is true because whenever we need a~big list, $\vert T_e\vert = \Omega(\log n/\log\log n)$,
874 so we need $\log\vert T_e\vert = \Omega(\log\log n)$ comparisons anyway.
875
876 \em{Pointers:} When we need to construct a~small list containing a~sub-list
877 of a~big list, we do not have enough time to see the whole big list. To solve
878 this problem, we will introduce \df{pointers} as another kind of edge identifiers.
879 A~pointer is an~index to the nearest big list on the path from the small
880 list containing the pointer to the root. As each big list has at most $\lceil\log n\rceil$
881 fields, the pointer fits in~$\ell$ bits, but we need one extra bit to distinguish
882 between normal labels and pointers.
883
884 \lemma
885 When~$f$ is a~function of two arguments computable in polynomial time, we can
886 precompute a~table of the values of~$f$ for all values of arguments which fit
887 in a~single slot. The precomputation takes $\O(n)$ time.
888
889 \proof
890 Similar to the proof of Lemma \ref{qhprecomp}. There are $\O(2^{2s}) = \O(n^{2/3})$
891 possible values of arguments, so the precomputation takes time $\O(n^{2/3}\cdot\poly(s))
892 = \O(n^{2/3}\cdot\poly(\log n)) = \O(n)$.
893 \qed
894
895 \example
896 We can assume we can compute the following functions in constant time (after $\O(n)$ preprocessing):
897
898 \itemize\ibull
899 \:$\<Weight>(x)$ --- computes the Hamming weight of a~slot-sized number~$x$
900 (we already considered this operation in Algorithm \ref{lsbmsb}, but we needed
901 quadratic word size for it). We can easily extend this to $\log n$-bit numbers
902 by splitting the number in three slots and adding their weights.
903
904 \:$\<FindKth>(x,k)$ --- find the $k$-th set bit from the top of the slot-sized
905 number~$x$. Again, this can be extended to multi-slot numbers by calculating
906 the \<Weight> of each slot first and then finding the slot containing the
907 $k$-th one.
908
909 \:$\<Bits>(m)$ --- for a~slot-sized bit mask~$m$, it returns a~small list
910 of the positions of bits set in~$\(m)$.
911
912 \:$\<Select>(x,m)$ --- constructs a~slot containing the substring of $\(x)$
913 selected by the bits set in~$\(m)$.
914
915 \:$\<SubList>(x,m)$ --- when~$x$ is a~small list and~$m$ a bit mask, it returns
916 a~small list containing the elements of~$x$ selected by the bits set in~$m$.
917 \endlist
918
919 \para
920 We will now show how to perform all parts of the procedure \<FindHeavy>
921 in the required time. We will denote the size of the tree by~$n$ and the
922 number of query paths by~$q$.
923
924 \lemma
925 Depths of all vertices and all top masks can be computed in time $\O(n+q)$.
926
927 \proof
928 Run depth-first search on the tree, assign the depth of a~vertex when entering
929 it and construct its top mask when leaving it. The top mask can be obtained
930 by $\bor$-ing the masks of its sons, excluding the level of the sons and
931 including the tops of all query paths which have bottom at the current vertex
932 (the depths of the tops are already assigned).
933 \qed
934
935 \lemma\id{verth}%
936 The arrays $T_e$ and~$P_e$ can be indexed in constant time.
937
938 \proof
939 Indexing~$T_e$ is exactly the operation \<FindKth> applied on the corresponding
940 top mask~$M_e$.
941
942 If $P_e$ is stored in a~big list, we calculate the index of the particular
943 slot and the position of the field inside the slot. This field can be then
944 extracted using bit masking and shifts.
945
946 If it is a~small list, we extract the field directly, but we have to
947 dereference it in case it is a pointer. We modify the recursion in \<FindHeavy>
948 to pass the depth of the lowest edge endowed with a~big list and when we
949 encounter a~pointer, we index this big list.
950 \qed
951
952 \lemma\id{verhe}%
953 For an~arbitrary active top~$t$, the corresponding entry of~$P_e$ can be
954 extracted in constant time.
955
956 \proof
957 We look up the precomputed depth~$d$ of~$t$ first.
958 If $P_e$ is stored in a~big list, we extract the $d$-th entry of the list.
959 If the list is small, we find the position of the particular field
960 by counting bits of the top mask~$M_e$ at position~$d$ and higher
961 (this is \<Weight> of $M_e$ with the lower bits masked out).
962 \qed
963
964 \lemma\id{verfh}%
965 The procedure \<FindHeavy> processes an~edge~$e$ in time $\O(\log \vert T_e\vert + q_e)$,
966 where $q_e$~is the number of query paths having~$e$ as its bottommost edge.
967
968 \proof
969 The edge is examined in steps 1, 2, 4 and~5 of the algorithm. Step~4 is trivial
970 as we have already computed the top masks and we can reconstruct the entries
971 of~$T_e$ in constant time (Lemma \ref{verth}). We have to perform the other
972 in constant time if $P_e$ is a~small list or $\O(\log\log n)$ if it is big.
973
974 \em{Step 5} involves binary search on~$P_e$ in $\O(\log\vert T_e\vert)$ comparisons,
975 each of them indexes~$P_e$, which is $\O(1)$ by Lemma \ref{verth}. Rewriting the
976 lighter edges is $\O(1)$ for small lists by replication and bit masking, for a~big
977 list we do the same for each of its slot.
978
979 \em{Step 1} looks up $q_e$~tops in~$P_e$ and we already know from Lemma \ref{verhe}
980 how to do that in constant time.
981
982 \em{Step 2} is the only non-trivial one. We already know which tops to select
983 (we have the top masks $M_e$ and~$M_p$ precomputed), but we have to carefully
984 extract the sublist. 
985 We have to handle these four cases:
986
987 \itemize\ibull
988 \:\em{Small from small:} We use \<Select> to find the fields of~$P_p$ which
989 shall be deleted. Then we apply \<SubList> to actually delete them. Pointers
990 can be retained as they still refer to the same ancestor list.
991
992 \:\em{Big from big:} We can copy the whole~$P_p$, since the layout of the
993 big lists is fixed and the items we do not want simply end up as unused
994 fields in~$P_e$.
995
996 \:\em{Small from big:} We use the operation \<Bits> to construct a~list
997 of pointers (we use bit masking to add the ``this is a~pointer'' flags).
998
999 \:\em{Big from small:} First we have to dereference the pointers in the
1000 small list~$S$. For each slot~$B_i$ of the ancestor big list, we construct
1001 a~subvector of~$S$ containing only the pointers referring to that slot,
1002 adjusted to be relative to the beginning of the slot (we use \<Compare>
1003 and \<Replicate> from Algorithm \ref{vecops} and bit masking). Then we
1004 use a~precomputed table to replace the pointers by the fields of~$B_i$
1005 they point to. Finally, we $\bor$ together the partial results.
1006
1007 Finally, we have to spread the fields of the small list to the whole big list.
1008 This is similar: for each slot of the big list, we find the part of the small
1009 list keeping the fields we want (\<Weight> on the sub-words of~$M_e$ before
1010 and above the intended interval of depths) and we use a~precomputed table
1011 to shift the fields to the right locations in the slot (controlled by the
1012 sub-word of~$M_e$ in the intended interval).
1013 \qeditem
1014 \endlist
1015
1016 \thmn{Verification of MST on the RAM}\id{ramverify}%
1017 There is a~RAM algorithm, which for every weighted graph~$G$ and its spanning tree~$T$
1018 determines whether~$T$ is minimum and finds all $T$-light edges in~$G$.
1019
1020 \proof
1021 Implement the Koml\'os's algorithm from Theorem \ref{verify} with the data
1022 structures developed in this section.
1023 According to Lemma \ref{verfh}, it runs in time $\sum_e \O(\log\vert T_e\vert + q_e)
1024 = \O(\sum_e \log\vert T_e\vert) + \O(\sum_e q_e)$. The second sum is $\O(m)$
1025 as there are $\O(1)$ query paths per edge, the first sum is $\O(\#\hbox{comparisons})$,
1026 which is $\O(m)$ by Theorem \ref{verify}.
1027 \qed
1028
1029 \rem
1030 Buchsbaum et al.~have recently shown in \cite{buchsbaum:verify} that linear-time
1031 verification can be achieved even on the pointer machine. They first solve the
1032 problem of finding the lowest common ancestors for a~set of pairs of vertices
1033 by batch processing, combining an~$\O(m\alpha(m,n))$ algorithm using the Union-Find
1034 data structure with table lookup for small subtrees. Then they use a~similar
1035 technique for the path maxima themselves. The tricky part is of course the table
1036 lookup, which they handle by radix-sorting pointer-based codes of the subtrees.
1037
1038 \rem
1039 The online version of this problem (build a~data structure for a~weighted tree
1040 in linear time and then answer queries for individual paths in constant time)
1041 is still open even for the RAM.
1042
1043 %--------------------------------------------------------------------------------
1044
1045 \section{A~randomized algorithm}\id{randmst}%
1046
1047 %--------------------------------------------------------------------------------
1048
1049 \section{Special cases and related problems}
1050
1051 Finally, we will focus our attention on various special cases of the minimum
1052 spanning tree problem which frequently arise in practice.
1053
1054 \examplen{Graphs with sorted edges}
1055 When the edges are already sorted by their weights, we can use the Kruskal's
1056 algorithm to find the MST in time $\O(m\timesalpha(n))$ (Theorem \ref{kruskal}).
1057 We however can do better: As the minimality of a~spanning tree depends only on the
1058 order of weights and not on the actual values (Theorem \ref{mstthm}), we can
1059 renumber the weights to $1, \ldots, m$ and find the MST using the Fredman-Willard
1060 algorithm for integer weights. According to Theorem \ref{intmst} it runs in
1061 time $\O(m)$ on the Word-RAM.
1062
1063 \examplen{Graphs with a~small number of distinct weights}
1064 When the weights of edges are drawn from a~set of a~fixed size~$U$, we can
1065 sort them in linear time and so reduce the problem to the previous case.
1066 A~more practical way is to use the Jarn\'\i{}k's algorithm (\ref{jarnimpl}),
1067 but replace the heap by an~array of $U$~buckets. As the number of buckets
1068 is constant, we can find the minimum in constant time and hence the whole
1069 algorithm runs in time $\O(m)$, even on the Pointer Machine. For large
1070 values of~$U,$ we can build a~binary search tree or the van Emde-Boas
1071 tree (see Section \ref{ramdssect} and \cite{boas:vebt}) on the top of the buckets to bring the complexity
1072 of finding the minimum down to $\O(\log U)$ or $\O(\log\log U)$ respectively.
1073
1074 \examplen{Graphs with floating-point weights}
1075 A~common case of non-integer weights are rational numbers in floating-point (FP)
1076 representation. Even in this case we will be able to find the MST in linear time.
1077 The most common representation of binary FP numbers specified by the IEEE
1078 standard 754-1985 \cite{ieee:binfp} has a~useful property:  When the
1079 bit strings encoding non-negative FP numbers are read as ordinary integers,
1080 the order of these integers is the same as of the original FP numbers. We can
1081 therefore once again replace the edge weights by integers and use the linear-time
1082 integer algorithm. While the other FP representations (see \cite{dgoldberg:fp} for
1083 an~overview) need not have this property, the corresponding integers can be adjusted
1084 in $\O(1)$ time to the format we need. (More advanced tricks of this type have been
1085 employed by Thorup in \cite{thorup:floatint} to extend his linear-time algorithm
1086 for single-source shortest paths to FP edge lengths.)
1087
1088 \examplen{Graphs with bounded degrees}
1089 For graphs with vertex degrees bounded by a~constant~$\Delta$, the problem is either
1090 trivial (if $\Delta<3$) or as hard as for arbitrary graphs. There is a~simple linear-time
1091 transform of arbitrary graphs to graphs with maximum degree~3 which preserves the MST:
1092
1093 \lemman{Degree reduction}\id{degred}%
1094 For every graph~$G$ there exists a~graph~$G'$ with maximum degree at most~3 and
1095 a~function $\pi: E(G)\rightarrow E(G')$ such that $\mst(G) = \pi^{-1}(\mst(G'))$.
1096 The graph $G'$ and the embedding~$\pi$ can be constructed in time $\O(m)$.
1097
1098 \figure{french.eps}{\epsfxsize}{Degree reduction in Lemma~\ref{degred}}
1099
1100 \proof
1101 We show how to eliminate a~single vertex~$v$ of degree $d>3$ and then apply
1102 induction.
1103
1104 Assume that $v$~has neighbors $w_1,\ldots,w_d$. We replace~$v$ and the edges~$vw_i$
1105 by $d$~new vertices $v_1,\ldots,v_d$, joined by a~path $v_1v_2\ldots v_d$, and
1106 edges~$v_iw_i$. Each edge of the path will receive a~weight smaller than all
1107 original weights, the other edges will inherit the weights of the edges $vw_i$
1108 they replace. The edges of the path will therefore lie in the MST (this is
1109 obvious from the Kruskal's algorithm) and as~$G$ can be obtained from the
1110 new~$G'$ by contracting the path, the rest follows from the Contraction lemma
1111 (\ref{contlemma}).
1112
1113 This step can be carried out in time $\O(d)$. As it replaces a high-degree
1114 vertex by vertices of degree~3, the whole procedure stops in at most~$n$ such
1115 steps, so it takes time $\O(\sum_{v\in V}\deg(v)) = \O(m)$ including the
1116 time needed to find the high-degree vertices at the beginning.
1117 \qed
1118
1119 \examplen{Euclidean MST}
1120 The MST also has its counterparts in the realm of geometric algorithms. Suppose
1121 that we have $n$~points $x_1,\ldots,x_n$ in the plane and we want to find the
1122 shortest system of segments connecting these points. If we want the segments to
1123 touch only in the given points, this is equivalent to finding the MST of the
1124 complete graph on the vertices $V=\{x_1,\ldots,x_n\}$ with edge weights
1125 defined as the Euclidean distances of the points. Since the graph is dense, many of the MST
1126 algorithms discussed run in linear time with the size of the graph, hence
1127 in time $\O(n^2)$.
1128
1129 There is a~more efficient method based on the observation that the MST
1130 is always a~subgraph of the Delaunay's tesselation for the given points
1131 (this was first noted by Shamos and Hoey in~\cite{shamos:closest}). The
1132 tesselation is a~planar graph, which guarantees that it has $\O(n)$ edges,
1133 and it is a~dual graph of the Voronoi diagram of the given points, which can
1134 be constructed in time $\O(n\log n)$ using for example the Fortune's
1135 algorithm \cite{fortune:voronoi}. We can therefore reduce the problem
1136 to finding the MST of the tesselation for which $\O(n\log n)$ time
1137 is more than sufficient.
1138
1139 This approach fails for non-Euclidean metrics, but in some cases
1140 (in particular for the rectilinear metric) the $\O(n\log n)$ time bound
1141 is also achievable by the algorithm of Zhou et al.~\cite{zhou:nodel}
1142 based on the sweep-line technique and the Red rule. For other
1143 variations on the geometric MST, see Eppstein's survey paper
1144 \cite{eppstein:spanning}.
1145
1146 \examplen{Steiner trees}
1147 The constraint that the segments in the previous example are allowed to touch
1148 each other only in the given points looks artificial and it is indeed uncommon in
1149 practical applications (including the problem of designing electrical transmission
1150 lines originally studied by Bor\o{u}vka). If we lift this restriction, we get
1151 the problem known by the name Steiner tree.\foot{It is named after the Swiss mathematician
1152 Jacob Steiner who studied a~special case of this problem in the 19th century.}
1153 We can also define it in terms of graphs:
1154
1155 \defn A~\df{Steiner tree} of a~weighted graph~$(G,w)$ with a~set~$M\subseteq V$
1156 of \df{mandatory notes} is a~tree~$T\subseteq G$ which contains all the mandatory
1157 vertices and its weight is minimum possible.
1158
1159 For $M=V$ the Steiner tree is identical to the MST, but if we allow an~arbitrary
1160 choice of the mandatory vertices, it is NP-hard. This has been proven by Garey and Johnson
1161 \cite{garey:steiner,garey:rectisteiner} for not only the graph version with
1162 weights $\{1,2\}$, but also for the planar version with Euclidean or rectilinear
1163 metric. There is a~polynomial approximation algorithm with ratio $5/3$ for
1164 graphs due to Pr\"omel and Steger \cite{proemel:steiner} and a~polynomial-time
1165 approximation scheme for the Euclidean Steiner tree in an~arbitrary dimension
1166 by Arora \cite{arora:tspapx}.
1167
1168 \examplen{Approximating the weight of the MST}
1169 Sometimes we are not interested in the actual edges forming the MST and only
1170 the weight matters. If we are willing to put up with a~randomized approximation,
1171 we can even achieve sub-linear complexity. Chazelle et al.~\cite{chazelle:mstapprox}
1172 have shown an~algorithm which, given $0 < \varepsilon < 1/2$, approximates
1173 the weight of the MST of a~graph with average degree~$d$ and edge weights from the set
1174 $\{1,\ldots,w\}$ in time $\O(dw\varepsilon^{-2}\cdot\log(dw/\varepsilon))$,
1175 producing a~weight which has relative error at most~$\varepsilon$ with probability
1176 at least $3/4$. They have also proven an~almost matching lower bound $\Omega(dw\varepsilon^{-2})$.
1177
1178 For the $d$-dimensional Euclidean case, there is a~randomized approximation
1179 algorithm by Czumaj et al.~\cite{czumaj:euclidean} which with high probability
1180 produces a~spanning tree within relative error~$\varepsilon$ in $\widetilde\O(\sqrt{n}\cdot \poly(1/\varepsilon))$\foot{%
1181 $\widetilde\O(f) = \O(f\cdot\log^{\O(1)} f)$ and $\poly(n)=n^{\O(1)}$.}
1182 queries to a~data structure containing the points. The data structure is expected
1183 to answer orthogonal range queries and cone approximate nearest neighbor queries.
1184 There is also a~$\widetilde\O(n\cdot \poly(1/\varepsilon))$ time approximation
1185 algorithm for the MST weight in arbitrary metric spaces by Czumaj and Sohler \cite{czumaj:metric}.
1186 (This is still sub-linear since the corresponding graph has roughly $n^2$ edges.)
1187
1188 \endpart